EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25201 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:45992757-45996428 
TF binding sites/motifs
Number: 22             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF14MA0740.1chr3:45995592-45995606AGCCACGCCCCCCC+6.35
KLF16MA0741.1chr3:45995593-45995604GCCACGCCCCC+6.62
KLF16MA0741.1chr3:45995801-45995812GCCACGCCCCC+6.62
KLF16MA0741.1chr3:45995947-45995958GCCACGCCCCC+6.62
NR4A1MA1112.2chr3:45995691-45995701TAAAGGTCAC+6.02
Nkx3-2MA0122.3chr3:45995605-45995618CAAACCACTTAAA+6.24
SOX21MA0866.1chr3:45993162-45993177TACAATTCTAGTGTT+6.15
SOX21MA0866.1chr3:45993800-45993815TACAATTCTAGTGTT+6.15
SOX21MA0866.1chr3:45994426-45994441TACAATTCTAGTGTT+6.15
SP1MA0079.4chr3:45995798-45995813CAAGCCACGCCCCCA+7.61
SP1MA0079.4chr3:45995944-45995959CAAGCCACGCCCCCA+7.61
SP1MA0079.4chr3:45995590-45995605CAAGCCACGCCCCCC+7.85
SP3MA0746.2chr3:45995800-45995813AGCCACGCCCCCA+6.34
SP3MA0746.2chr3:45995946-45995959AGCCACGCCCCCA+6.34
SP3MA0746.2chr3:45995592-45995605AGCCACGCCCCCC+6.74
SP4MA0685.1chr3:45995798-45995815CAAGCCACGCCCCCAAA+7.18
SP4MA0685.1chr3:45995944-45995961CAAGCCACGCCCCCAAA+7.18
SP4MA0685.1chr3:45995590-45995607CAAGCCACGCCCCCCCA+7.45
SP8MA0747.1chr3:45995801-45995813GCCACGCCCCCA+6.11
SP8MA0747.1chr3:45995947-45995959GCCACGCCCCCA+6.11
SP8MA0747.1chr3:45995593-45995605GCCACGCCCCCC+6.44
Znf423MA0116.1chr3:45995393-45995408GAACCCCTGGGGGGC-6.86
Enhancer Sequence
TATCTAGATT AGAGAGTCGT AGAAGCTTGG GAGAGGCCTC ATTTTACTCG GCCTATCAAG 60
TCGGTATTAA GTAGTGACAT AACAAATTTG TAGACACTCC CTAGCAACCA CTTTAGGCCC 120
CCTAACAACC ATATACCAAC ATAAACAAGC CATATTTTAG CACAGGAATA TCGTAGAAAG 180
ACAGGGTTTG GGTTCTTTTG ATGCAGGTTG ATCAAATCTC TATCGTCTTC ACCTATTACA 240
AAGGCGTTGC CACACCCTAG CAACCATTTA CATTACCCTA GCAACCACAT AAGTACATGA 300
ATTTAACCAT TTCTCCACAT TTCCTGCTAT TTTGCCCAGT TTAGTACCAT TTTGTACCCC 360
ATCGATTTGC CACGCAAACC CCATTCACAT TTCCTTTAGG AAATGTACAA TTCTAGTGTT 420
ACTATTACTG TTCACTTTTT CAATCCTTCG GCGCGCAACT CCGCCCCCAT TTTTTGCCCT 480
AGAATGATGA GTGAGGTGTC AAATCGACTT GCCTGTTGAG GAGAGGTGTG CTATGATTTT 540
TCAAAGAGGT TGGGGGTACA CTGCCCCCAT CAGGGGCAAG AAAGTAACCC CCCAAAATCC 600
CCATAGACTT AACATGGACA CAAAATGGCT GACATTGATA TCTAGATTAG AGAGTCGTAG 660
AAGCTTGGGA GAGGCCTCAT TTTACTCGGC CTATCAAGTC GGTATTAAGT AGTGACATAA 720
CAAATTTGTA GACACTCCCT AGCAACCACT TTAGGCCCCC TAACAACCAT ATACCAACAT 780
AAACAAGCCA TATTTTAGCA CAGGAATATC GTAGAAAGAC AGGGTTTGGG TTCTTTTGAT 840
GCAGGTTGAT CAAATCTCTA TCGTCTTCAC CTATTACAAA GGCGTTGCCA CACCCTAGCA 900
ACCATTTACA TTACCCTAGC AACCACATAA GTACATGAAT TTAACCATTT CTCCACATTT 960
CCTGCTATTT TGCCCAGTTT AGTACCATTT TGTACCCCAT CGATTTGCCA CGCAAACCCC 1020
ATTCACATTT CCTTTAGGAA ATGTACAATT CTAGTGTTAC TATTACTGTT CACTTTTTCA 1080
AAACTTCGGC ACGCAACTCC GCCCGCATTT TTTGCCCTAG AATGATGAGT GAGGTGTCAA 1140
ATCGACCGGC CTGTTGAGGA GAGGTGTGCT ATGATTTTTC AAAGAGGGTG GGGGTACACT 1200
GCCCCCATTA GGGGCAAGAA AGTAACCCCC AAAATCCCCA TAGACTTAAC ATGGACACAA 1260
AATGGCTGAC ATTGATATCT AGATTAGAGA GTCGTAGAAG CTTGGGAGTG GGCTCATTTT 1320
ACTCCGCCTA ATAAGTCGGT ATTAAGTAGT AACATATAAA GTTTGTGGAC ACTCCCTAGC 1380
AACCACTTGT AGGCCCCTAA CAACCATATA ACAACATAAA CAAACATATT TCAGCTTAGG 1440
AATATCATAG AAAGACAGGA TTTGGCCTCT TTTGATGCAG GCTGATCAAA TCTCTATTAA 1500
GTTCAGCTAC TAAAATGGCG TTGCCACAAC CTAGCAACCA TGTACAATAC CCTAGCAACC 1560
ACATAAACAC ATGAATTTAA CCATTTACTG CTATTTTGCC CAGTTTAGTA CCATTTTGTA 1620
CCCCATCGAT TTGCCACGCA AACCCCATTC ACATTTCCTT TAGGAAATGT ACAATTCTAG 1680
TGTTACTATT ACTGTTCACT TTTTCAAAAC TTCGGCGCGC AACTCCGGCC GCATTTTTTG 1740
CCCTAGAATG ATGAGTGAGG TGTCAAATCG ACCGGCCTGT TGGAGAGAAG TGTGCTATGA 1800
TTTTTCAAAG AGGTTGGGGG TACACTGCCC CCATCAGGGG CAAGAAAGTG ACCCCCCAAA 1860
ATCCCCATAG ACTTAACATG GACACAAAAT GGCTGACATT GATATTTAGA TTAGAGAGTC 1920
TTAGAAGCTT GGGAGTGGGC TTGTTTTACT CCGCCTATCA AGTCGGTATT AAGTAGCGAC 1980
ATAACAATTT TGTAGACACT CCCTAGCAAC CACTTTAGGC CTCCTAACAA CCATATAACA 2040
ACATAAACAA GCCATATTTT AGCACAGGAA TATCGTAGAA AGACAGGGTT TTGCTTCTTT 2100
TGATGCAGCT TGATCAAATC TCTATTGTCT TCACCTATTA CAAAGGCGTT GCCACACCCT 2160
AGCAACCGTT TACATTACCC TAGCAACCGC ATAAACGCAT GAATTTAACC ATTTCTCCAC 2220
ATTTACTGCT ATTTTGCCCA GTTTAGTACC ATTTTGTACC CCATCGATTT GCCACGCAAA 2280
CCCCATTCAC ATTTCCTTTA GGAAATGTAC AATTCTAGTT ATAATTATTA TTCTTCTTCT 2340
TCCGTACGTT TTTCGGCGCG TAACTCGTCC CGCAGCTTTC GTCCCAGACC CTTGAAAGTG 2400
GGGTCAAATC GTGCGGTCTT ATCGGGAATG GTGTGCTATG ACTTTTATAA GGGGTGGGGG 2460
GTTTTTTGGC CCCGCAGGGG CCAAAAAACA CCCCCAAAAA TCCCATAGAC TTAACATTGA 2520
GCCGAACTTT GACGAATCAC AGCGCCGAGT CTGAATTTCG TAGAAATATG GGATTCGCAA 2580
CAGCTGTAGG GGGTTGCAGC CTAAGTGAGA ACATACCACG CAGGGGGGTA TAAGTTGAAC 2640
CCCTGGGGGG CTAGGACGTC CCAAAGTGGT CCCATTGACT TAACATGGGC CCCATTGACT 2700
CCCATTCATT ACATTGACTC CCATTATAAA TGTCACATGT CAATCACAGT ACATAGCAGT 2760
GTCATACTGA CTTGGGGGTG GGCTCATTTG ACTCAGGCAA CCAATCAGCA TCTCACTATG 2820
ATTTTGAAGC TCACAAGCCA CGCCCCCCCA AACCACTTAA AGACCCCTAA TAAGTGCCCC 2880
ATTGACTTAA CATGGGGTGG GATGTCCCAT TGCAGATCCC ATTGACTTCC ATTATAAAGG 2940
TCACACATCT ATAACATTAC ATAGGAGTGT CATAGAGACA TGGGGGTGGG CTCATCTGAC 3000
TCAGACAACC AATCAGCATC GCAATATGAT AATGAAGCTC ACAAGCCACG CCCCCAAACT 3060
GGTCCCATAG ACTGCCATTA TAACTGCCCT ACATGCATAT CTTTGCTTAG CAGTGTCCTA 3120
TTGGCTTGGG GGATGGCTCA TCTGACTCAG ACAACCAATG AGCATCTCAA TATGATAATG 3180
AATCTCACAA GCCACGCCCC CAAACTGGTC CCATAGACTG CCATTATAAC TGCTCTACAT 3240
GCATATCTTT GCTTAGCAGT GTCCTATTGA CTTGGGGGTT GGCTCATTTG ACTTGGACAG 3300
CCAACCACAT TCAAGTTCAC TCTGTAACCT CGCCCATAGC AACAAAACAG AGTACCCTAG 3360
CAACCGTTCA TCAACAGCTA TATCTCAGCA TCGGAACATC GTAGAGACTT GGGGATTGGC 3420
TCGTTTGACT CATGCTAGCA AACGGAACTT CCTATATGCT ACACATGCTA GCAGTGACTA 3480
GCTACATGCT AATATTGACT AGCCATGTAC TGTAACTTGC TAGAAATGCT TACTAAGTAT 3540
AAATATTTCA TCAGGCATGT ATGTGAGGCT TGCCTAGTAA CCACCCAGGG TACCCTAGCA 3600
ACTGCCTAGC AACCACCCAA ATTACCCTAG CAACCGCCTA GCAACCACCT AGCAACCGCC 3660
TAGTAACGCC T 3671