EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25191 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:45963125-45966416 
TF binding sites/motifs
Number: 24             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF14MA0740.1chr3:45963450-45963464AGCCACGCCCCCCA+6.26
KLF16MA0741.1chr3:45963451-45963462GCCACGCCCCC+6.62
KLF16MA0741.1chr3:45963611-45963622GCCACGCCCCC+6.62
KLF16MA0741.1chr3:45963757-45963768GCCACGCCCCC+6.62
KLF16MA0741.1chr3:45963903-45963914GCCACGCCCCC+6.62
NR4A1MA1112.2chr3:45963501-45963511TAAAGGTCAC+6.02
SOX21MA0866.1chr3:45965152-45965167TACAATTCTAGTGTT+6.15
SOX21MA0866.1chr3:45965789-45965804TACAATTCTAGTGTT+6.15
SP1MA0079.4chr3:45963608-45963623CAAGCCACGCCCCCA+7.61
SP1MA0079.4chr3:45963754-45963769CAAGCCACGCCCCCA+7.61
SP1MA0079.4chr3:45963900-45963915CAAGCCACGCCCCCA+7.61
SP1MA0079.4chr3:45963448-45963463CAAGCCACGCCCCCC+7.85
SP3MA0746.2chr3:45963610-45963623AGCCACGCCCCCA+6.34
SP3MA0746.2chr3:45963756-45963769AGCCACGCCCCCA+6.34
SP3MA0746.2chr3:45963902-45963915AGCCACGCCCCCA+6.34
SP3MA0746.2chr3:45963450-45963463AGCCACGCCCCCC+6.74
SP4MA0685.1chr3:45963448-45963465CAAGCCACGCCCCCCAA+7.06
SP4MA0685.1chr3:45963608-45963625CAAGCCACGCCCCCAAA+7.18
SP4MA0685.1chr3:45963754-45963771CAAGCCACGCCCCCAAA+7.18
SP4MA0685.1chr3:45963900-45963917CAAGCCACGCCCCCAAA+7.18
SP8MA0747.1chr3:45963611-45963623GCCACGCCCCCA+6.11
SP8MA0747.1chr3:45963757-45963769GCCACGCCCCCA+6.11
SP8MA0747.1chr3:45963903-45963915GCCACGCCCCCA+6.11
SP8MA0747.1chr3:45963451-45963463GCCACGCCCCCC+6.44
Enhancer Sequence
AGAGCACTAA ACGCGCCGCG AAATGGGACG ACCTTTAAAG CGTTATAGCG CCAAGTGTGA 60
AATTCGTAGA AATATGGGAT TCGCAACATC TGTAGGGGGT TGCAGCCTGT ATGAGTACGT 120
ACCCCAAAAG GGGGTATAAG TTGTACCCCT AGGGTGCTAG GACGTCCCAA AGGGGTCCCC 180
ATTGACTTTA CATGGCCCAT TGACTCCCAT TCATTTCTTG ACTCACATGT CAATCACAGT 240
ACATGGCAGT GTCATACAGA CTTGGGGGTT GGCTAACTTG ACTGAGGCAA CCAATCAGCA 300
TCTCAATATG ATTTTGAAGC TCACAAGCCA CGCCCCCCAA ATCATTTAAA GCCCCTTAAT 360
ATTAATAATT CCATTATAAA GGTCACACAT CTATAACATT ACATAGGAGT GTCATAGAGA 420
CATGGGGGTG GGCTCATTTG ACTCAGGCAA CCAATCAGCA TCACTATATG ATAATGAAGC 480
TCACAAGCCA CGCCCCCAAA TTGATCCCAT AGACTTCTAT TATAATTGGG CTAGATGCAT 540
ATCTTTGCAT TGCAGTGTCA TACAGGCTTA GGGGTTGGCT CATTGGACCC AGACAACCAA 600
TGAGCATCTC AATATGGTAA TGAAGCTCAC AAGCCACGCC CCCAAACAGG ACCCATAGAC 660
TGCCATTATA ACTGGCCTAC ATGCATATCT TTGCTTAGCA GTGTCCTATT GACTTGGGGG 720
ATGGCTCATC TGACTCAGAC AACCAATGAG CATCTCGATA TGATAATGAA GCTCACAAGC 780
CACGCCCCCA AATTGGTCCC ATAGACTTCC ATTAAAATAG GCCTACATGC ATATCTTTGC 840
TTAGCAGTGT CCTATTGACT TGGGGGTTGG CTCATTTGAC TTGGACAGCC AACCACATTC 900
AAGTTCACTC TGTAACCTCG CCCATAGCAA CAAAACAGAG TACCCTAGCA ACCATTCATC 960
AACAGCTATA TCTCAGCATC GGAACATCGT AGAGACTTGG GGATTGGCTT GTTTGACTCA 1020
TGCTAGCAAA CGGAACTTCC TGTATGCTAC ACATGCTAGC AGTGACTAGC TACATGCTAA 1080
TATTGACTAG CCAAGTACTG TAACTTGCTA GAAATGCTTA CTAAGTATAA TTATTTCATC 1140
AGGCATGTAT ATGAGGCTTG CCTAGTAACC ACCCCGGGTA CCCTAGCAAC TGCCTAGCAA 1200
CCACTCAAAT TACCCTAGCA ACCGCCTAGC AACCACCTAG CAACCACCTA GTAGCGCCTT 1260
AGTAAGGGCC TAGCGACCAC TCAGGACACC CTAGCAACCG CCTAGCAACG CCTTAGCAAC 1320
CACTTAGAAT ACCCTAGCAA CCACCTAGCA ACGCCTTAGC AACGACCTAG CAACCACTCA 1380
GGACACCCTA GCAACCGCCT AGCAACACCT TAGCAACCAC CTAGCAACCA CTCAGAACAC 1440
CCTAGCAACC GCCTAGCAAC GCCTTAGCAA CCACTTAGAA TACCCTAGCA ACCACCTAGC 1500
AACACCTTAG CAACCACCTA GCAACCACTC AGGACACCCT AGCAACCGCC TAGCAACCAC 1560
TCAGAACACC CTAGCAACCG CCTAGCAACT ACCTAGCAAC CACTCAGAAC ACCTTAGCAA 1620
CCACCTAGCA ACCCCTCAGG GCACCCTAGC ACTGTTGCTA GCATGATGCT AGCAACTCGA 1680
TTAGCATGTT GCTAGCATCA TGCTAACACG ATTAGCATCA TGCTAGCTAC ATGCTAATCA 1740
AGTTAGCATG ATGCTAGCAA CTCGATTAGC ATGTTGCTAG CATGATGCTA ACACGATTAG 1800
CATCATGCTA ATTACATGCT AATCATGTTA GCATGATGCT AGCATCTCGA TTAGCATGTT 1860
GCTAGCATGA TGCTAACATT ATTAGTATCA TGCTAGCTAC ATGCTAATCA TATTAGCATG 1920
TTGCTAGAAC CTCGATTAGC ATGTTGTTGC TTTTTGGCCA GTACAGTGAT GCATTTTACC 1980
CCATCGATTT GCCACGCAAA CCCCATTCAC ATTTCCTTTA GGAAATGTAC AATTCTAGTG 2040
TTACTATTAC TGTTCACTTT TTCAATCCTT CGGCGCGCAA CTCCGGCCGC ATTTTTTGCC 2100
CTAGAATGAT GAGTGAGGTG TCAAATCGAC CGGCCTGTTG AGGAGAGGTG TGCTATGATT 2160
TTTCAAAGAG GGTGGGGGTA CACTGCCACC ATGAGGGGCA AGAAAGTAAC CCCCAAAATC 2220
CCCATAGACT TAACATGGAC ACAAAATGGC TGACATTGAT ATCTAGATTA GAGAGTCGTA 2280
GAAGCTTGGG AGTGGGCTCA TTTTACTCGT CCTATCAAGT CGGTATTAAG TAGTGACATA 2340
ACAAATTTGT AGACACTCCC TAGCAACCAC TTTAGGCCCC CTAACAACCA TATAACAACA 2400
TAAACAAGCC ATATTTTAGC ACAGGAATAT CGTAGAAAGA CAGGGTTTGG GTTCTTTTGA 2460
TGCAGGTTGA TCAAATCTCT ATAGTCTTCA GCTATTAAAA TAGCGTTACC ACACCCTAGC 2520
AACCATGTAC ATTACCCTAG CAACCACATA AACACATGAA TTTAACCATT TCTCCACATT 2580
TACTGCTATT TTACCCAGTT TAGTACCATT TTGTACCCCA TCGATTTGCC ACGCAAACCC 2640
CATTCACATT TCCTTTAGGA AATGTACAAT TCTAGTGTTA CTATTACTGT TCACTTTTTC 2700
AAAACTTCGG CGCGCAACTC CGGCCGCATT TTTTGCCCTA GAATGATGAG CGAGGTGTCA 2760
AATCGACCGG CCTGTTGAGG AGAGGTGTGC TATGATTTTT CAAAGAGGGT GGGGGTACAC 2820
TGCCCCCATG AGGGGCAAGA AAGTAACCCC CAAAATCCCC ATAGACTTAA CATGGACACA 2880
AAATGGCTGA CATTGATATC TAGATTAGAG AGTCGTAGAA GCTTGGAAGT AGGCTTATTT 2940
TACTCGTCCT ATCAAGTCGG TATTAAGTAG CGACATAACA TATTTGTAAA TGCCCCCTAG 3000
CAACCACTTT AGGCCCCCTA ACAACCATAT AACAACACAA ACAAGCCATA TTTTAGCACA 3060
GGAATATCGT AGAAAGACAG GGTTTGGGTT CTTTTGATGC AGGTTGATCA AACCTCTATT 3120
GTCTTCACCT ATTACAAAGG CGTTGCCACA CCCTAGCAAC CATTTACATT ACCCTAGCAA 3180
CCACATAAAC ACATGAATTT AACCATTTCT CCGCATTTAC TGCTATTTTG CCCAGTTTAG 3240
TACCATTTTG TACCCCATCG ATTTGCCACG CAAACCCCAT TCACATTTCC T 3291