EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25131 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:43054273-43055170 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr3:43054586-43054597TATGTAAATAT+6.62
FOXC1MA0032.2chr3:43054586-43054597TATGTAAATAT+6.62
Hmx1MA0896.1chr3:43054600-43054617ACCAACAATTAATGATT+6.94
Hmx2MA0897.1chr3:43054600-43054617ACCAACAATTAATGATT+6.71
Hmx3MA0898.1chr3:43054600-43054617ACCAACAATTAATGATT+6.87
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr3:43054424-43054435CTTGAGTGGTT-6.32
Enhancer Sequence
GGGGGTTTTG GCCATTTCCA AGCTGGTTTT AGCTGGCCAG GCTGGGAAAT GACCAGCTAA 60
AACCAGCTTG ACCAGACAGG TTTAAGCTGG ACATAGCTGG TATTAGCTCC CAGCCTGACC 120
AGAAAAATTA AGATTTACTA ATTTCCTCAC CCTTGAGTGG TTTTATCCTT CATGAGTTTC 180
TTCTGTTGGA CACAGGAGAA TATATTTTGA AGAAAGCTGA AACTCAAACA GGTTTGAGAG 240
AGTAATTGAT GAGATAATTT GAATTTTTGG GTAGCCTAAT ATTGCCCTCG TAAGATCTCG 300
TTTGACAAAC ATATATGTAA ATATAAAACC AACAATTAAT GATTTTATGC TGTACATTTC 360
TTGATGACGC TGAACGAGCA AACAATAAAG AGAAACCAAC CAAATCCTAT TGTTGTCTGT 420
GTTTCGTTTG TAAATGAAAA CTGGTTGTAC GATGACATCT AGTGGTGGGA TCTTCCAATT 480
TAGGATACTT ACAGGAGTCA CATGTAGTCC CGTCCCAGCG TTCCTCCCTC CCTCCATTGC 540
TCCAGTTTCA TTCACCTCAT ACTTTCACAT AAAAGACAAC AAGCTCTATT AATGAACCTG 600
ATGTCATTTC TGTGCAACGC TGGGAATGAG AGTGAGGATA CAGGGAAAGG ACGAACACCA 660
TTTACCAGGA GACTTTTAAG GACACGAGGT GGGAGTTAGA TTTCCTCTTT GGCCTAGAAA 720
AGACAACACG AGCTTTGCCA GCTCCAGAAT TCCCATCATT CCCTGGAAAT TAACACATTC 780
ATTTTAGGTA AAGGAGAATG CACACCAGAC CAGCTATGGT CATTTTCAAA GCTCCAGAAT 840
GAGCCATTCG TCTCGCTCTG AATGTGTGTG TTGGATCAGT GCAGTGTTTT CTGTACA 897