EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25130 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:43009248-43011234 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATF2MA1465.1chr3:43010664-43010678TGATGATGTCATAA-7.06
Alx1MA0854.1chr3:43009651-43009668TGAATTAATTAATCTAC+6.72
ArxMA0874.1chr3:43009651-43009668TGAATTAATTAATCTAC-6.57
BHLHE23MA0817.1chr3:43009311-43009323AAACATATGCTG+6.04
BHLHE23MA0817.1chr3:43009472-43009484AAACATATGCTG+6.04
FOXB1MA0845.1chr3:43010248-43010259ATATTTACATA-6.62
FOXC1MA0032.2chr3:43010248-43010259ATATTTACATA-6.62
JUNMA0488.1chr3:43010663-43010676TTGATGATGTCAT+6.92
JUND(var.2)MA0492.1chr3:43010662-43010677ATTGATGATGTCATA+7.19
Lhx3MA0135.1chr3:43009652-43009665GAATTAATTAATC+6.54
POU6F1MA0628.1chr3:43009654-43009664ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:43009654-43009664ATTAATTAAT-6.02
ZNF24MA1124.1chr3:43009644-43009657GAATGAATGAATT-7.22
ZNF24MA1124.1chr3:43009382-43009395AAATGAATGAATG-7.34
ZNF24MA1124.1chr3:43009550-43009563GAATGAATGAATA-7.52
ZNF24MA1124.1chr3:43009386-43009399GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr3:43009546-43009559GAATGAATGAATG-7.82
Enhancer Sequence
GTAGTGTATG TGTGTGGATG TTTTCCAGTA CTGGGTTACA GCTGAAAGGA CATCCGCTGT 60
GTAAAACATA TGCTGGATAA GTTGGCGGTT CATTCCGCTG TGGCAACCCC TGATGAATAA 120
AGGGACTAAG CCGAAAATGA ATGAATGAAT GATACTGGCC GTAGTGTATG TGTGTGAATG 180
TATTTCCAGT ACTGGGTCGC AGTTGAAAGG GCATCCGCTG CGTAAAACAT ATGCTGGATG 240
AGTTGGCGGT TCATTCTGCT GGTGACCCCT AATAAATAAA GGCAATAAGC CAAAAAGAGA 300
ATGAATGAAT GAATAAAATT ATCAGTAGTG TATGAGTTAG CAGTGCATTC TGCTGTGGAA 360
ACCCTTGATG AATAAAGGGA AGTTGAAACT GAAGGAGAAT GAATGAATTA ATTAATCTAC 420
AAACTAGATA CTACATAATC AACCTCGCAC TTTGTCTGAG AAACCCGGAA GAGTGGTTGT 480
CGTCACTGTC AGTGTGACGT CACTGACTTT TAATACATCC CAAAGAAGGC ACTACTACAA 540
TTTCAGCAAC AGAGGGCGAC ATAGAGCAAC AAATCTGTGC CGTAATCCTA CAGGTTTGAT 600
TGCAGATTAA TAAATCACAT ATTTTCATAC ATTTAAAAAC GCTCGTATGT CTGGCTCCTG 660
ACATTTTCGT GTAAGCATCA CTCATACACA ACTATGTATA ATATATGCTT AAATACATAA 720
TAGAAATAAG TGTTGTCTTC ACATTTAGCT AACATGACAT TACGCAAGTA AATGAATGAA 780
AACTATGACT AAAATCTATA AGAGGAAAAT AAAAAGGCTG CAAAGTAAAC TCGGTCATAT 840
AACCACTCTG GGGTTTCTAA GAACGTCCCT TCCTAGTTTC TAAATTTGGA AATGACTTCT 900
AGGAAAAGAG AAACTGCCAG CTCCATATGT TTTATCTTCC ACGTGTTTAG ACGTCGCTCC 960
CTTTTAAAGC AAAAGGAAAA AAGGCAGCGA GTCAGAGTAG ATATTTACAT ACTGACACCC 1020
ATTGAAGATC ATTAATAGAC TAAATGGTGA GTGTCGGCGG CTCGGGGTTT TGCGCACAAT 1080
TGGCGTGCGC TGCTGAAAAT GGCATCTCCC CCATGCGCGG CCCCTGCTTT ACCTAGTAGC 1140
GTGACCATGA AGCAATGCAC GAGCAGAGAG ATCTTAACAT GCACAGAGTC AGTCTGGCTC 1200
CTCGAGACGC CTGCTCATCT CGCCAGCAGG AGCACGTACG GCGTGCACTT AAAGAAGACA 1260
ACATCTGATT CAAGCCGGCC AGATGTTTCA TTCCGTCGCG CTGCGCTTTA TTCGTGGCGA 1320
GGTAAGTTTC CAGATATGTT ACATGGATGT GCGCGCGTTT TCAGCGGCAG GTGTGATCGG 1380
AATCGGGGCA GCGGGTAGAA TACTTATAAA TTCCATTGAT GATGTCATAA TAGGCATTCT 1440
GCTTAGCCGT TACAATGGGG GAATTGGCGT TCGAATGGAA AAGGAGAATA GCGGATAGAG 1500
ATCGCCAACG TGATGTGCGT TCTTTTAAAG CAACAGCCTG ATGTTTTAGT CGCATATTGC 1560
TGCTTTTGGC GGGTATTGCT CGCAGACAGA GGCAGACAGA TTGTGTCTGA GAGAGTACCT 1620
GAACTCTCTG GGGAGTCGAA CACACTGTCT GGGACTCAAT TGACGCCCGG CTGTCTCTCT 1680
TAACACAAAG ATCTTGATGG AGCTTTAGAA AGCCTTCATG CTTGAAAACA GGTGAAGTTC 1740
GATTGATTTT GTAGCCGGTT TAATTATGTG TGTGATTTTT TTTTTCCTTC ACTTGGTGCC 1800
ATTACCGGAG AAGGTCACTA TTGCTTTGAT TAGTGGTCAA ATATTTTAGA GAAAGACATT 1860
GGACATGCGT GGTGTTTGTC ATGTTCAAGT TTATTTGTGT CACGCGTTCC GCAATATAGG 1920
CTACGGCGTT TGATAGAGGC AGACCAGATA TATTCTGTTC CTCTTTTAAT TCATTGATTG 1980
TAAATT 1986