EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25101 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:42254480-42255673 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr3:42254967-42254986TCGCCACCAGGTGTCAGTG+6.58
DBPMA0639.1chr3:42255088-42255100TATTACGTAATG-6.18
Foxd3MA0041.1chr3:42254684-42254696GTTTGTTTGTTT+6.32
HLFMA0043.2chr3:42255088-42255100TATTACGTAATG-6.11
Nkx3-2MA0122.3chr3:42255482-42255495TAAACCACTTAAA+7.04
TEFMA0843.1chr3:42255088-42255100TATTACGTAATG-6.22
Enhancer Sequence
ACAGTTTACT TCCAACCCTG ATTAAACACA CCTGATCAAA CTAATTGAGT GCTTTCGGCT 60
TGTTTGATAC CCACAGATAG GTGTTGATGC AGGGCTGGAA GCTTGACACC CATGAAACTT 120
AAAGGTTTGG ATCAACTTAA GGGTGAGTAA ATTTTCATTT TTGAGTGAAC TGACCCTTTA 180
ATTTACAGTT AACTCTCGAG CTATGTTTGT TTGTTTTTTT AGCGTAGCGA TAAATGTTAG 240
CGCACATACC ATTCAAAAAC GGCAGATATT AACAAAGAAA ATATCGCACA CCCTCACTCA 300
CGATACCAAG AAAATTGAGT GAATTTTAAA GAATGTACAC AAATGAGTTA TGGCTTTGGT 360
GGCAGCTGAA TTGAACTCAC ACACAAACAA AAAAGCAAAA CAAAAATGCC TCAAAAGTCC 420
AAGAAACAAA CGGAGATCTT GGTGTCATCA GCATTTGATC ACAGCATTTT GAAGGAGAAA 480
ATACAACTCG CCACCAGGTG TCAGTGTAAA GCGCAGAAAG AGCTGTTTTG TCAAGCTGTT 540
TTGTCAAGCT GTATATAACT CCATAAAGGA GGATTAAGTG ACTTTTAATG GAACTGGATC 600
AATTCCAATA TTACGTAATG TGTTAGGAAT CTCAGAGGAA CAAAATAAAT GGCCACAATG 660
ACGAATGGTA AATGTCAGAG TTTTTTTCTC TCACTAAAAA GCTTTTGTGG CCTAAAAGGG 720
AAGTGGAGAC AGCAATTTAA AAACTCATTC GTCTATAAAA GCGGATTTGC CAACCAGAGC 780
TGTGGTCACA TTTATATATT AGAATACAAA GGTCATGGTT TGAAATGCTG ACTGCAGGTT 840
AAACCTTTCA TAACAATGCC AAATAAACGA TGAATACTGA AATGACACCT AAACACACCA 900
CATTTCACCC ATAATAAACT AATAGTGTGT TGCATTCATA ATATTGTACA TATTGTTCAA 960
AAGATATTGT GTGTGTGTTT CTGCTGCTCA TCGACAATTG AATAAACCAC TTAAAGACAA 1020
ATCACACCAG TCCTGGATAT AGATATAAAC TATAGAGGCA ATGAGGAATT TAGATCATGT 1080
TGGGGGATAT AAAGACATAC AAAAACACTT GTGGCGATAT AAACCCCAAT ATGCTTCCTT 1140
GCATTGGTGG AAGGGCTCAC AAAATAAAAA AAGGTCATAG CCACTTAGGT AAG 1193