EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25098 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:42051005-42053951 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr3:42052866-42052887ATTTTGTTTCAGTTCCACTTT-6.07
IRF1MA0050.2chr3:42052866-42052887ATTTTGTTTCAGTTCCACTTT+6.65
RARA(var.2)MA0730.1chr3:42052696-42052713TGACATTTACGTGACCT+6.99
RARA(var.2)MA0730.1chr3:42052696-42052713TGACATTTACGTGACCT-6.99
Rarb(var.2)MA0858.1chr3:42052696-42052713TGACATTTACGTGACCT+6.92
Rarb(var.2)MA0858.1chr3:42052696-42052713TGACATTTACGTGACCT-6.92
Sox6MA0515.1chr3:42053188-42053198AAAACAATGG+6.02
Sox6MA0515.1chr3:42053188-42053198AAAACAATGG-6.02
ZNF384MA1125.1chr3:42052914-42052926TTTTTTTTTTTA+6.37
ZNF384MA1125.1chr3:42052914-42052926TTTTTTTTTTTA-6.37
Enhancer Sequence
GAGTATGATG GCACAGATAC AAGCAGCACT GTTGAAGATG ATACTGACTT CATGGACTGT 60
TTGTCTTATG TCGATGCACC TGAATGCAGC AACATCATGG CAAGTGCATC ATTCATTAGT 120
CTATCTGACT CAGAGTCGGA CTCTGATGCA GATACTGAAT TGCATTCAAG TTCTCTTAAC 180
GACGACTTGG CAAGTTGGGC AACAGAAAAC AAAATAACAC ACGTGGCACT AAATTCCTTA 240
CTCAGCATCC TTCGAAATCA TAATCTGAGT CTTCCTAAAG ATGCAAGGAC GTTATTAGGA 300
ACAGTGCGTT CAAAAAAACA AATGCAAAAT AAAGCTGGTG GCCAGTACTA CCATTTTGGT 360
TTACTGGAAT CCATTTCAGG GGTCCTCTAT GACAACAAGG ACATTTTGAG GAACACAACA 420
GATTTGAAGC TCCAGGTGAG CATTGATGGT CTTCCTTTAT ACAAAAGTTC ATCAACTCAA 480
TTCTGGCCCA TTCTTGGCAA AGTACAAAAC TTGGTGCAGG AGAAGCCTGT AACAATAGGG 540
TTATTTTGTG GTGACAGCAA ACCAAGCTCC CTGGACGAAT ACCTCAAAGA CTTTATCTCT 600
GAAATCAAAG AGTTAGGAAA TGGATTTGAA TTTGAAGGAC TGAAGTTAAC AGTCAAGCTT 660
ACCTCTATGA TCTGTGATGC ACCTGCACGT GCATTTCTGA AAAAAGTGAA AGGCCATGCA 720
GGTTACCATG GATGTGAAAA GTGCATACAG GATGGTGTGT ACCTGGAGAA CAGGATGACA 780
TTTCCTAGAA CTGACATGCC TCTAAGAAAT GATGAGAGCT TTAGAAATAA GACTGACATA 840
GACCACCACC ATGGCACCTC ACCTCTGGAG GAAACCTCCC TGGACATGGT TTCTGGATTC 900
CCCCTTGACT ACATGCACCT TGTGTGCCTT GGTGTCATGA GGCGGCTTCT ACACCTTTGG 960
CTTCGACTGG GCCCTCTAAC TTGCAGGCTG TCAGGATTTC AAGCATCTGT GCTGTCAGAA 1020
CGGTTAGTCA GTGCCCAGAA GAACGTGCCT GTAGAATTTG CACGCAAACC AAGAGCAGTC 1080
AGAGAAATAG ATCGATGGAA GGCAACTGAG TTTAGGCAAT TCTTACTGTA CACAGGCCCT 1140
GTGATGCTAA AAGACCTGCT CACCACTGAA GCATACAAAA ACTTCCTGCT GCTTTTTGTG 1200
GGAATCTTCA TCCTTTGCAA TGACAGCCTA ATTGGTGATC ACATTGACTA TGCCAATGAT 1260
ATTCTCCGAC TGTTTGTGAC ACACTTTGGA CAGCTATACG GTCCAAAATT TCTGTCTTAT 1320
AACGTCCACT GTCTTGTCCA TCTGGCAGAA GATGCAAAAC ACCATGGTGT CCTTGACAAT 1380
TTCAGTGCGT TCATTTACGA GAATCACCTT AACAAGCTGA AGAAACTTCT ACGAAAACCT 1440
TCATGTCCGT TAAGTCAAGT CGTGAGAAGG TTCTCAGAAC TGCACACCTG TAACAAAAAA 1500
AGAGACAAAA ACAAGGCACC AGTGCTCAGA AAACCGCATG CTGCTGGCCC TCTACCGGAG 1560
TCATTTGTTG GAGCTTCACA GTTCAAAGAA CTACAAACAG AGTCATACAC TCTGAAATTA 1620
AACCAGGCAA ACCGTTTTGT CTACATTAAT GGAAAGGTTT CAAAGCTAGA AAACATATTT 1680
TCAGAAAATG ATGACATTTA CGTGACCTAC ACTACCTTCA GCAAACATGA ACTCTTTTTT 1740
GACTATCCCC TTCCATCCTC CGCACTTGGC ATCTACCAAG TTGATGTCAT CTCAGGACCA 1800
GTCCAGCTCT GCAAAATTGA GAACATTGAG GCAAAAGCTT TCCTAGTCCC TTGCGGCAGT 1860
TATTTTGTTT CAGTTCCACT TTTACACACA AAATAATTCC CTATACCAAT TTTTTTTTTT 1920
ACCTTTTTTT ATTTTAATAT ATACTGTATA GTGCAGTGTG TATAATCATC ATGCAAGATG 1980
ATATTTATTC AAGAGCATTT TGTAAATTCC AAACTTCACT CACAACTATA ACCAATATAT 2040
ATATTTTTAT ACGAAGGCAA GAAGTGAAAA ACGCTTTATT TAAATGTGTA CTATTATTTA 2100
GCAAGTTATT AAAATTGACA ATTATTAAAA AGGATGCAAT GCTAATCAAA TGCTAAAAAA 2160
TGCTACATAA AATGATAAGT CCGAAAACAA TGGTTCAAAA ATGTTTATAT AGTCATTACT 2220
TTTTCATTAC AATTTTGAAT TTCTTTACAC AAGTTCTTGC ATTAGGTAAC TCTTTATTTT 2280
GATGGTCCAT TTAAGTATTA GTAGACTGTC TGCTCAGTAT CTGTTGATAC TGCTCCTTCA 2340
ACAGACATTT AACTGGCTAT AGGAAACTTT GCAAGTACAT GTCAACTTAC ACTAACCCTA 2400
ACCCCAACTT AACAGTCTGC TTATAATCTT CTGAAAATTA GTTGACATGT AGAGAACTTA 2460
AATTCAACTA ACTGACTAAT GAAATACAGT GTGACTTACA TTGTACTTTT TTCACTTCCA 2520
GTCTTGACGG ACAATTATAT AACAATTATA AATGATTAAT ACAAAAATAC TAGTGGTTAA 2580
GATTGATGTT TGGAATTGGT AAAATGTGCT TAAAAATACA ATCTAAATAT TAACTTGCAT 2640
AATAATTTTG CACAAAATGT AGTTTGTGTA TTTGCACAAA AACAACTCAA ATTTAATTAT 2700
TCAACGTTAT GGGGGCCTAG GTTCTTGCAG TTTTAAAAAA ACAAAAATGT ACCTCTTGGT 2760
GGAGCTCCTT CATGAAGAAA GTACCGGATC TGTAGCAAAG TTTTAGTACT CAGAGGGTCA 2820
CTCATGGTAG CCTCTATACA AAAAGATAGA CTGGATATTG AAGAGTGTCC GGTTGATGGA 2880
GGCACCACAA CCAGAAAAAG GTTGGACCAA GCATCAGGCC AGAATTCCAC ATGAGTTGGG 2940
TAAGCA 2946