EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25077 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:40823440-40824650 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXD2MA0847.2chr3:40823454-40823467GTTATATAAACAA+6.08
GabpaMA0062.2chr3:40823781-40823792CCGGAAGTGGG+6.02
Hmx2MA0897.1chr3:40823564-40823581ACAATCAATTAATTGAT+6.8
Hmx3MA0898.1chr3:40823564-40823581ACAATCAATTAATTGAT+7.18
IKZF1MA1508.1chr3:40823814-40823826ATTTCCTGTTTT-6.11
Enhancer Sequence
CAGACAAGAG ATTAGTTATA TAAACAAAGA TCCTAAAATG TATTAAATGT AGTGTGATAC 60
ACGATAAGAA CACACAACTA TTAATTTAGT GAGATATAAA AGAGAAATAA CAAAATATTG 120
CATCACAATC AATTAATTGA TTTGCTGTTA TTTGTTATGT TACTGTTATC GTGAATGAAT 180
ACTCACATAT ACAGGAGGGT TAAAACCAGA ACCACCAGGA TCCAGGTCAC AGACAGAGAT 240
GAAAGATCAA TCATTGTAAA TCACTGTATT ATTCAGTACA CTAGTGGCCT CATGCACAAC 300
GATACTGTCA GCTCTGGATC TATTCCGTCC CGACGGAGGA TCCGGAAGTG GGTGTACAAA 360
AGGTTCGACA TACAATTTCC TGTTTTCAGC AATGAAGCTA TCGTAAATCT CCAGTAATGT 420
CTTTATCTTG AAGAATGACG AAATACACTC ACCCACAAAA CCAAACAAAG TTCGTCCTAG 480
AATGTAAAAC AGAGTATCAG GTGGATTTTA CTAACCTTAC AAGAACAGAG TAATAAGCTT 540
GAGCTTTACA TCGCGTCTTC ACAAACCAAA CCTATATTCT GTGTTTTGCT ACTCAAAAAC 600
GTTGTCCTTG TATTGTCATG CTTTATAGAG GCTTTGTGTA CAAAACTGAA ACAGAATTAA 660
ACGTTTCTCT CTCTCTCTCT CTCTTACACA CACACTCACG CACGCACGCA CACACGCACA 720
CGCACACGCA CACGCACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 780
CACACAAAAC GCGCTTTTCA CAACTCTTAA CCACAAAGAT CCGTATAGCC AGCCTGGTGT 840
AAGGGGCGGT TCTTTTTCTC AAAAAGAGGA CCATTTAGCA GTTTTCGCCC CATTTTCAAT 900
TTACATTTTT TTCTGATTGC TTAAGCACAA TTTTGAAATT AAGGCTCATT TTGTCAAAAC 960
ACACAATTCA CATCCACACA CATAAACAGC AGAACACATC AGAACTTTTG CAAAACAATT 1020
TTAACACCTT ACAGAACACA CACGCCTCAT TCAATATCTG TTTCCTTCAT TTACACACTG 1080
CTGTAATCAA TCATAAAACA CTTGTATCAT TTTTACTGAC TAATACTGAT ATAATAAATG 1140
TTTGAAAGAT ATTGCAATAA AGTACATGAA CATGTATTCA CCAAACAGTG ATAGACTGAT 1200
AGCTAAATAT 1210