EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25073 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:40648737-40649864 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF5MA0599.1chr3:40649187-40649197GCCCCGCCCC+6.02
LMX1BMA0703.2chr3:40648943-40648954TTAATTAAATT-6.32
PHOX2AMA0713.1chr3:40648944-40648955TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr3:40648944-40648955TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr3:40648944-40648955TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr3:40648944-40648955TAATTAAATTA-6.62
Enhancer Sequence
CATGCCACAA AGAAAAATAT ATTTTATTAT CTTTGATATC AATAAACTTA ATGTGATGTA 60
CTGTGTTGCT CGAAACTCTT TAAAGTTTAC ATTATTCTTT TAAGTGAATA AGACCACCAA 120
CTGTACGATT AATCTGGAAA ATGCCAACCC TAACACAGAA AAATTTTTTT TAATTGCTTA 180
AAAACTTCAT ATCTCCTTAA AGGCCTTTAA TTAAATTAAT TACACATAAT ACGTAGCCCG 240
TGAGGTGTAC TGCACTATAA TTTAACCATT TAGGCTACAT GACAGAAGAC GTGTACTTAC 300
CATGCAGAGA TGAAAACCGG AATCGAAAGC ATACATTACA TCAACGTCAA TATGTTTCCG 360
TGAACCAATG AAAGACTTGT AGGCGGAGCG ACATGTTCAG TCCCGCCTAC TTATGGGCGG 420
GGTTGAATAT GCAGCCCCGC TCCGTATTCA GCCCCGCCCC GATCTGCGGG CTGCAGACGG 480
GTGTACTTGC CGCTATCGGC AAAGCACGCT TAAAATTTAC ACATGATATC TATAAATAAA 540
CCACAGATTT GAGTTTGTAA GAACTACATT CTCGCATGAA ACACTGTTAA AATTTCATTT 600
CGTGACATAT TAAACGCAAT ATTTATAATA TTAGCTGGGC TTTCTCATCC GCCATTACCA 660
TTTGCTTATT GATGTGAAAT GAATTCTGGG AGAAAAAAAA TAAAAATATT AATTCTCAAA 720
ACACTTCAAA CGAACTTTAT TTCTTATTGT CAAGGTCAGA TATATGTAAT AATCTCGCTG 780
GTAAAGTGAA TAAAAAACAA TGTTACTATA TTGTGATCAA TATCACGTTT GCACTGGTTC 840
GGTTCAGCAC TCGAGCGACT CGTATTGAAC CGAATTGAAC CGTTTGCTCG GGAACTATTT 900
GATCACACGT GTTCACAAGC ACATTCAGCA ATATGCATTT AGTGTATAAT TAGTGTATAA 960
ATGCGTGTGG CCAAGCAGTA TAACGAAATA GTAATGAATC ATATACAAAA AGGAATCAAT 1020
TTTAGGCGGA TTCGATTCTT TACTGTTCAC TAAGTAGCCG ATTTATAGAA CCGAACGGAC 1080
ACGACTCGAC ATGCAGGCAA CGTCATTAAC TTATTGTAAC TTAACTG 1127