EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-25049 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:39617179-39618229 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr3:39618053-39618064ATATTAATTAA+6.62
Foxj3MA0851.1chr3:39618113-39618130GTTTTTGTTTATGTTCA-6.03
LMX1BMA0703.2chr3:39618056-39618067TTAATTAAAAC-6.14
ZNF384MA1125.1chr3:39617325-39617337TTTTTTTTTTAA-6.44
ZNF384MA1125.1chr3:39617326-39617338TTTTTTTTTAAT-6.74
Enhancer Sequence
AAGAACAAAT GAATAATTAT GCAAAATTGA TAATAAAAAA ATATTATTTT TGTATCTTAC 60
CTGTCAAGTA GCCTTACATT GACAAAGAAA ACATAGATGA GTAGCCTATA TTTTAAACGT 120
TAAACAGGTT CATACGAATA CATTTGTTTT TTTTTTAATA TTATGTAATA TGTTCAATAT 180
CCGTCGTCCG TTTTTTTTCT TTCAGCGTAT ATGCAGTAAA CCGTGTAGCT ATTATAATTA 240
AGTTCCATAA GCATATTTTC AGCATGTCTA AAGATACTTG GTCCTAAAAG GAATAATAAA 300
CGGGCGTCAG GTGTGAAGTA ATGCGGGTAA AGCCAAAGGA AGCGTCATGC GCGCGCTCGC 360
GCTCTGCTCA CTAGAAGTTT GGCGTGTCAC ATCAAGGGAG AATCCAGACC AACATAGATG 420
CACCAAACCC TTTCGCAGTT TTTCCTTTGG ATAATGGCTT TTCTTGCTTT ACATCTGAGA 480
CACTCTGGCA TGTTTTGGGA TAAATCGCCC ATGGTTTGTT AATTTTAAAG AAAACTGAAA 540
GACTTACGCA TCGTTCAGTG GCAGAAACTG CATTTGAAAG AGACAAATGG ATCATAGCGA 600
GTCTCAGTCT CTTACCAGAA CGGATTTTTC TGCGGTACAC TGAAAGTAAA GGAGATGCTT 660
ATGGGAACCT CTGATTCCTT ATCTATAAGG TAACTTGTTT GTTTTGTTTT GTAAGTTGCG 720
TTTAACATCG ATTTCTGTCA CAGCATGCTT TTGTGTGGGG AAATTAGGAC GGTTGGGAAG 780
AAGTAACGTT ACTGTAGAAA GATTGGAGAT TTTCGTAACA GCATTATTTT CTTCGGCAGC 840
TGTTGGCAGC TTTTTGTCTT TGATATATCT TTTTATATTA ATTAAAACAT TTACAATGCA 900
AAATATAAAA CTGGTATATA TTAGTGATCC GTTTGTTTTT GTTTATGTTC AAAAGAAATC 960
TCGGGCAAAG CTTGATCTTG TTTGTTTGGT GCATCTGACG AGCGCTTTTC TCTTTACTGT 1020
GACAATCATA AGACCGTGAC AATCAGCTCT 1050