EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24900 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:36459580-36461180 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATOH1(var.2)MA1467.1chr3:36460255-36460265AACAGCTGTC+6.02
BHLHE23MA0817.1chr3:36461059-36461071AAACATATGCTG+6.04
NEUROD1MA1109.1chr3:36460690-36460703AGACAGATGGCAA+6.42
Sox1MA0870.1chr3:36460652-36460667TACAATAATATTGTT+6.06
TP53MA0106.3chr3:36460014-36460032AACATGTCAGGGCATGTA+7.41
TP53MA0106.3chr3:36460014-36460032AACATGTCAGGGCATGTA-8.28
TP63MA0525.2chr3:36460014-36460032AACATGTCAGGGCATGTA-6.06
TP63MA0525.2chr3:36460014-36460032AACATGTCAGGGCATGTA+7.21
TP73MA0861.1chr3:36460014-36460032AACATGTCAGGGCATGTA-6.86
TP73MA0861.1chr3:36460014-36460032AACATGTCAGGGCATGTA+6.99
ZNF24MA1124.1chr3:36461135-36461148AAATGAATGAATA-6.42
Enhancer Sequence
TGTTGTACTT GGGTAGTCTT TGGTTGCTAA TATGGTTTTC CTGTTTAGAA TTTGGAAAGA 60
CTACTTTTCT GAAATTATAT TATTAAGGTG AAAGTCTGTA TGTGCGAATA TAAAACCAAC 120
TTTAGTTCAA TATTTGTGAG TGGGTTTATC TAAGTGCACC TTAAGGAAAA AAATATGACT 180
TTTAAAATAA TTATTCCAAC TACTTGAAAT TGACTTAACA CTGAACTCAA CAGAGCTAAA 240
TAACAGCATT ATTGACAATA ACTGATAACA TGAAAATTAA AACATTGACA TACACTGCTA 300
CTGAATTGAA ACTAAACAGT CCTGAACTTC ATTTTAAGAC CGAAAGAGTG AATAAAAATA 360
AGACTCGCCT TAATATCCGG GTCTGAGAGT TGATGTTTTA TCAGCTCATA GTCGCTTGTG 420
TCGCCCTGAA TCAGAACATG TCAGGGCATG TATTACAGAT AGTAATACTC ATACGTTGTA 480
ATGTTTTTTA TAATTTAAGT TAGTCTAACG CACCTTTTGT AGTTTAGCCA AAGTATTGGC 540
AACTGTGCCT CCAAAGCGCA CCGTTTTCAA TGGTGGTGTA TTGATGAAAT CTCTGCCTTC 600
AATCTCCATT ATGTATGAGA AACACAATGT TCTGAAAGCA GATAAAACAA TATGACAATA 660
TTGTCAACGA CAACTAACAG CTGTCAAATG TATCCGTTTA TCAGTTTATT ATGTAAACAC 720
TGCCTATACA AATACACACA TAACGTAAAT ATAAACAACA GCATATATGA TGTGCGAAGA 780
TCTTTAACGA CTGCTCGTTG TTATTACAAT TAATTACGCG AGGTAATTAA TCGGCACTTA 840
CCAAACAGTA TTTAATCAAA TAAATATATA CCTAAATTAA GCATTATACG CATAATGTAG 900
CTGTCACATG CGTGACCATG CCGCGATACG CCAACCGGAA GCTCTGTTTT GTTGTTACGG 960
AAGCAGCCGG TTTAGTTCAG TTGTGTTACA GAAATGGAGG TTGTGTTAAA GAAAGGTTCT 1020
GCCACCTTGT GGTTTGAAGT GTAATGATGA CTTGATGTTG TCTTGCTTTG CTTACAATAA 1080
TATTGTTCAT CACGGGGCTC CTTGGTGGAC AGACAGATGG CAAAAGGTTG CCTACGTATA 1140
TTACAAAATT GAGTGTTAAC ATTTACGATT TGTCTATGAT AAAGTGAATA TGGTAACACT 1200
TTACAACACT TTGGCACAGT GGGTAGCATG ATAACTTCAC AGCAAAAAGG TCGCTGGTTC 1260
GAGCATCAGC AGGGTCAGTT GGCATTTCTG TGTGGAGTTT ACATGTTCTC CCCGTGTTGG 1320
CGTGGGCTTC ATCCGGGTGC TCCAAGTTTC CCCCACAGTC CAAAGACATG CGCTAAAGGT 1380
GAATTGGGTA AGCTAAATTG GCTGTGTCTG TGTGTGAATG CAAGAGTTTA TGAGTGTTTC 1440
CCAGTGATGG GTTGCAGCTG GAAGGGCATC CGTTGTGTAA AACATATGCT GGATGAGTTG 1500
GTAGTTCATT CCGCTGTGGC GATCCCTGAT TAATAAAGAG ACTAAGCTGA AAAGAAAATG 1560
AATGAATATA ATATTGTACT TTCTCTATAT AAGATTAGAT 1600