EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24883 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:35780691-35781839 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr3:35780799-35780818CTGTCAGCAGGTGGCGCTA+6.51
CTCFMA0139.1chr3:35781066-35781085CTGCCAGCAGGTGGCGCTA+8.36
CTCFMA0139.1chr3:35781197-35781216CTGCCAGCAGGTGGCGCTA+8.36
CTCFMA0139.1chr3:35781502-35781521TAGCCAGCAGGTGGCGCTA+8.67
IKZF1MA1508.1chr3:35781317-35781329ACTTCCTGTTCC-6.44
Enhancer Sequence
CACCGCCGCC CGGTGACCTT ACGATGGCAG AGAACAGCGA ACAATAATAA TTTAAGCCAA 60
TATATATAAA AAATCTAAGA AAATCACAGA TTTATGCCAA ACTTCCTCCT GTCAGCAGGT 120
GGCGCTATAA CTGTGACTTA AGATTGGCAT GTAGATGTCT TCCGGAGAGG AATCTGATCA 180
ACCATGTGAA GTTTCAGGCA CATGGGACAT TGTGTGGCTG AGTTATAAGC CAAACTACCT 240
TCTGCCAGCA GGTGGCGTTT TGACTGACTC AATATTGTTA TGGGGATGTG TTCAGGAGCG 300
GACTTTTATC AATCATGTGA AGTTTCAGGC AGATCAGAGA TTGTGTGGAG ATTGTGTTTT 360
AAGACAAACT ACATTCTGCC AGCAGGTGGC GCTATGAAAG ACTCAATATT ATTATGTAGA 420
TGTGTTTAGG AGAGGACTTT CATCAACCAT TCGACATTTT AGGCAGATCT GACATTGTGT 480
GGCCGAGTTA TAAGCCAAAC TACCTTCTGC CAGCAGGTGG CGCTAAGACT GACTCAATAT 540
TGTTATGTGG ATGTGTTCAG GAGAGGACTT TTATCAATCA TGTGAAGTTT CAGGCAGATC 600
AGACATTGTG TGGTTGAGTT ATAATAACTT CCTGTTCCAT GGCGAAGCGT TGAGGTTTGT 660
CATGCCACCA CAGACACGCC CCTCTGCAAA AACTCTAGAT CTTCACAATA TATCATCGCT 720
AGAGCTTTCA GATGACACCA CTCTATTTTG GTGCTGATAC GGGAAAGTTT GTGGAAGGAG 780
TTTGTTACAG TGTCAAACAT GTCATTTCCT GTAGCCAGCA GGTGGCGCTA TAACTGTAAC 840
TGGATATCGG CACGTAAACC TGTTCAGGTC AGGACTTTTA TTAAATGTGT GAATTTTGAG 900
GCAGATCGAA TATTGCATGC CTGAGTTATA ACGACTACCT GTCTTGTGGC AAATCATCAA 960
CGTTTGCGAG GCCGCCACGG ACACGGCCAT CGATGAAAGC TCTAAAGCTT CGCAATTTAA 1020
CATCACCAAG GCTTTAAGAT GACAAAACCC AATTTTGGTG TCAATCAGAT AAAATCCCTA 1080
GGAGGAGTTC GTTAAAATAC AACGCTTGGA AATGGCAAAA ATGCCACTTT TTCGCCGCAG 1140
GAAGTTAA 1148