EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24863 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:34621996-34623072 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr3:34622110-34622120AACAGCTGTT+6.02
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr3:34622110-34622120AACAGCTGTT-6.02
GBX2MA0890.1chr3:34622073-34622083GCTAATTGGT-6.02
MSCMA0665.1chr3:34622110-34622120AACAGCTGTT+6.02
MSCMA0665.1chr3:34622110-34622120AACAGCTGTT-6.02
MYF6MA0667.1chr3:34622110-34622120AACAGCTGTT+6.02
MYF6MA0667.1chr3:34622110-34622120AACAGCTGTT-6.02
ONECUT1MA0679.1chr3:34622694-34622708ATTATTGATTTATT-6.36
ONECUT2MA0756.1chr3:34622694-34622708ATTATTGATTTATT-6.53
ONECUT3MA0757.1chr3:34622694-34622708ATTATTGATTTATT-6.82
TFAP4MA0691.1chr3:34622514-34622524AACAGCTGAT+6.02
Tcf21MA0832.1chr3:34622108-34622122AAAACAGCTGTTAT-6.39
Tcf21MA0832.1chr3:34622108-34622122AAAACAGCTGTTAT+6.64
Enhancer Sequence
GGGTTGATAA TTCACATACT GCACCAAAAA CAGAGACAAA AAATATGTCA TATGAATTTT 60
CAAATGTTCT AAGAATTGCT AATTGGTAAG TGCAAAATAA TTATGATTAG ATAAAACAGC 120
TGTTATAATT ATGTTATAAT TGCAACATGT CTATACAAGA TAGATAGATA GATAGATAGA 180
TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA 240
TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA 300
TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATGCCTT TAGGTCCAAT GTTCTTCAAA ATGACCCCTC 360
AGTATGACTG GTCCTTCAGC ATTTCTTTAT GCATGTGTGT TTGATAATTC ACATAATGCA 420
CTACTGTATC AAAAACAGAG ATAAAAGTAC TTCATATTAA TGTTCAGATG TTCTTAGAGT 480
TCCTATTTGG CCTGTGCAAA ATAATTGGGA TTAGATAGAA CAGCTGATTA TGTTATAATT 540
GCAACATGCC TGTTAAGACT TGCAACAATC CTGCTAAACA GTAATTATTA GTCCTTTATA 600
ATCACAATTC TGAGTTTTTA AGTTTGTGTC AACATCGGCT AGTTGCCTGT TAAAAAAAGA 660
CACCTTGAAA TTCAAGGATT ACATTACATC AAAGAAAAAT TATTGATTTA TTCTATGCCA 720
AAATGCTTTA GAAGACAAAA AAAATAAATA AATAAAAAAC GACCACCTAT AGCTAAGGAC 780
AAGTCATCCA ACAACAGTGA AGTACACATG ACTGATCTCT GAATCATCAA ATATTTCCAG 840
ATAACATTTA ACCAAGGCCT TTTCATACAC AACTGTTCTG TAAAAATAAA TGATGTGAGG 900
AATGATTAAC TCATTACACT TCAAGTGTGC CTTATTTTCT AATATTTCTA TGAACCAAGG 960
TCAATTATCT TGCTTATACT CCAGTTAACA CCAATCCGAT GTTGTATTTC AATACATGTC 1020
ACATGTTTTG TGTCCTAAAA CTTCCCTAGC GCTAATTACT TACAAACCTC ATCTGT 1076