EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24856 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:34456476-34457216 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr3:34456551-34456572TTTTGCTTTCACTTTTTAGTG+6.38
IRF2MA0051.1chr3:34456550-34456568TTTTTGCTTTCACTTTTT-6.19
POU4F3MA0791.1chr3:34456504-34456520ATGCATATTTTATAAG+6.02
Enhancer Sequence
CGTTTTAATT TAATGAATTC TAACTTGCAT GCATATTTTA TAAGATACTT CATTTAAAAA 60
TAGAGTACAG TACATTTTTG CTTTCACTTT TTAGTGGTTA AATAATGATT AGTGCCATGA 120
GAGCAAATGT CACATCAGAA GTTAAAATGA AATAGGTACT CACCTGAGTA CGTTTTCTTC 180
ATGTTCATTG ATTCCCTTTT CTCCTGAGAA TTTCAACTTT AGTCTATAAG GTCCGTGTGG 240
GAGATCTGAA CAACATCTGA AATATGATCT ATCGGTGAGG AGAAATTCTC TCTGTCGCTC 300
CGTACAGCAC ATGTACCTAT CACGGCCAAA AGCTTTGTGT TTTATTCGAA CTTAAACCTA 360
CGAGTTCGGC TTGATCTAAT CTAATCTAAT ACTCCCATAC ACCTCCAGCT TTACCTGTCC 420
ACACAGACAC ACACCTGTGG AAACTCCGCC TATGGATGAA GGTATGACGA CACAACTGAC 480
TGCGGGAACT GTAGGAGTAA ACAAACATGG ATGTGACATT TCTGTCAGAG TATTTTCAGC 540
TTCAAGTCAC ACGTAGCTTA AGTAGCACGT AGTCTAAAGA CGTGGTATAG GTGAATTGGA 600
TTCGCTAAAT TGTTCGTAGT GTATGTGTGC AAAAAAGTGT GGGTGTTTTC CAGTTTTGGG 660
TTGCGGCTGG AAGGGCATCC GCTGCGTAAA AATATGCTGT ATAAGTTGGT GATTCATTCC 720
TCTGTGGCGA TCACTGAGGA 740