EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24711 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:29556762-29558182 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE23MA0817.1chr3:29558016-29558028AAACATATGCTA+6.32
FOXB1MA0845.1chr3:29557833-29557844TATGTAAATAT+6.62
FOXC1MA0032.2chr3:29557833-29557844TATGTAAATAT+6.62
IRF1MA0050.2chr3:29557462-29557483CTTAGGTTTCGGTTTCTTTTC+6.45
IRF3MA1418.1chr3:29557465-29557486AGGTTTCGGTTTCTTTTCTCC-7.33
IRF4MA1419.1chr3:29557465-29557480AGGTTTCGGTTTCTT-6.37
IRF8MA0652.1chr3:29557466-29557480GGTTTCGGTTTCTT-6.09
IRF9MA0653.1chr3:29557466-29557481GGTTTCGGTTTCTTT-7.33
ZNF24MA1124.1chr3:29558075-29558088TAATGAATGAATG-7.12
Enhancer Sequence
ACATTTTGCT CATAATCGAC TACAACGGTA AATAATTGAA TTTGGATTCT TTACTTGCTG 60
ATTAACAAAC TTATTGAACG CAGAGGTCGG AATGTGCGAA TATAAAACCA ACTTTACTTC 120
TATCTAGTTT TTCTGCTTTC TGTGTTGCTG TTGTTGTTGT TTTGTTATAT AACTTATCTC 180
ATCTGATGGA CAAAAGTTAA GCTCCTTCAT CTGGTTATAA ACGAACTCAA GGATTTCACT 240
CTGAAATGAC TTATCTAAGT TAAGGGATTG TTCACTCAAA ATGTACATTT CCACACAATT 300
TACTCATAAA CAATCAACCT TTAAGAATTT ATTTCTTCTG TTCAACACAT TAAAAGAGAA 360
TCTGAAGAAT GTTGGAAAAA AACAGCTATT GACATCCATA TTAACCAAAA ATACAGTTAA 420
AGTTAATGGC TGAATTTACC CAACAACAAT GTCATATTAT CTTCGTGTTT GTTTAACAGG 480
AAAACAAACT CAAAAATTTA GCCCAATTGT TGACAGATAA ATTACATTTA AGTAACTTTA 540
ACATATGGCA GCAAACAAAC AACTTCGATC TAAAATATTA CTTATATAAA ATAACAGGCT 600
ACTCACCTGC TGTCCATCGT ACAGCCTGCT ATGCCGATGT AAACCTGCTA GACTGAGTAA 660
AGAAAACTAC AGGTAAATCT TTTGTTTATA ATGGAGGAGA CTTAGGTTTC GGTTTCTTTT 720
CTCCATTTCA GTTGCTCCGC CTGTAACCAA GAATTCTGCG TCAATCAAAT CCCAACTTGC 780
TTCTCTCACG AAAAATAGTT CCACGTTGAA TGTTATCAGT CGCCATCAGC CAAAGACAAT 840
ATAAAGGCGC ATTGTATGGC TGTGCTGCTG ATGACTCCGT CAGACATTCC TGTGCTCACA 900
TGGCTTTTAG CGTCATGCGT TTGTTCAGTC CATAAGAGGG CGTTGAACCT CATGCAGTTA 960
GGGATGTCCT GGTTTTGGGA AATATGTTTT CAGATTTTTT TTAAAAAAAT TCATTCTCGT 1020
GAAAAGTGTG GCTTGGTTTT AAACGCTCAC TGATGCTATG CAAAGATAAA TTATGTAAAT 1080
ATTAAATACT TTTAAATAGT TCCATATGAG ATATAAATGT TAAAAAAAGT ACAAACATTA 1140
TAAATGTCCA TATTGCGGTG TAAGCAACCA GCCATGAAAT TTTGTGCACA ATTTGATATT 1200
TTTACATACT TTTTCCCAGT GATGGATTGC GGCTAGAAGG GCATCCGCTG CGCAAAACAT 1260
ATGCTAAATT GACGGTTAAT TCCGCTGTGG CGACCCCAAA TTAATAAAGG GACTAATGAA 1320
TGAATGATTA CTTTACTCTT GAATAATTAT GCTGTTCAAT GAGAGGGTAC CCATCTTTTT 1380
AGATCCCGAC ACACTTTGTT AACAGGATTG CCTTTTTCAA 1420