EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24589 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:24405971-24407614 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr3:24406827-24406837AACAGCTGTT+6.02
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr3:24406827-24406837AACAGCTGTT-6.02
BHLHE23MA0817.1chr3:24407368-24407380AAACATATGCTG+6.04
CTCFMA0139.1chr3:24406243-24406262TCGCGCCCTCTGGTGGAAC-6.12
IRF1MA0050.2chr3:24406418-24406439GTTAACTTTCGCTTTCGTTTC+7.28
IRF2MA0051.1chr3:24406417-24406435GGTTAACTTTCGCTTTCG-7.17
IRF3MA1418.1chr3:24406421-24406442AACTTTCGCTTTCGTTTCATC-6.29
IRF7MA0772.1chr3:24406422-24406436ACTTTCGCTTTCGT-8.42
IRF8MA0652.1chr3:24406422-24406436ACTTTCGCTTTCGT-6.61
IRF9MA0653.1chr3:24406422-24406437ACTTTCGCTTTCGTT-7.05
MSCMA0665.1chr3:24406827-24406837AACAGCTGTT+6.02
MSCMA0665.1chr3:24406827-24406837AACAGCTGTT-6.02
MYF6MA0667.1chr3:24406827-24406837AACAGCTGTT+6.02
MYF6MA0667.1chr3:24406827-24406837AACAGCTGTT-6.02
Tcf21MA0832.1chr3:24406825-24406839TCAACAGCTGTTGT+6.89
Tcf21MA0832.1chr3:24406825-24406839TCAACAGCTGTTGT-7.22
Enhancer Sequence
GCCCGCTGGC CCTAGTTTGG GCATCTGTTT TATAACGATA ACTTAAAAAC CAGTAATTAC 60
TTTCCAGTTA TTGTTGTTGC CATGTTTTTT TTCTTTATAG CTTCATTATT ACAATATTTT 120
GACTGCAAAC ATGATATAAG TTTAAATACT CTTTATAATT TACAACGTTA ATAGTAAAAG 180
TTTCAACAGA TTCACTGTAT GTACTGCTGT TTTACCATCT GGCGTATAGA TTCAGGTTTT 240
GCTGGCATGT CTTAATATTT TCAATGGATA ATTCGCGCCC TCTGGTGGAA CAAAGAAGCA 300
CTAGCTTTAA TGGTCATGCA GCTTTATATC CTACTTTTGA TTTTACCAGT AGTTTTTACC 360
TAAAGTCGTT TTAATACAAA AGTTTAAATG CTAAAATAAG CATTCTGTAG TTTTTATCAA 420
ATTCGATTAG CATGACTTAG TCTAAGGGTT AACTTTCGCT TTCGTTTCAT CACTTCCCGC 480
GAACTATCCC GTATGAGTAA GATTTGCTTC ATTCAGGCGG GAGATTTGGA AACAACAACA 540
ACTGATTCTG CACGGCTTTT GTCAAGCCAA AAGTACACAA ATCCCCCATA CAGCTCAAAC 600
TTTAACAGGT ACGTACGAGT TAAATAAGCA AATGTTGCTT TTAGACCTCT GTATAGTTCA 660
ACTTTCTCCC TATTCTTCAT GGCGATGTGT TGCACAAGGC TTCGTAATAA TGCATGTCAT 720
GCAGAACTGT ATCTGGTGTG CTGTAGGTGT ATCTTCATGC CGCACGCAAA GTTATTTAAA 780
TGATTTCATG TCGTATATCA GATCGTTGAA TTCATGGGAG TCATCGACCA AATGGAGTTG 840
GATTTTCTAA CGAATCAACA GCTGTTGTCA TTTTTCCGCC GCAAAAAGAC GGAGATTTCG 900
TGCATTGAGC AACCGCACAT TTTCCTCACA CAGCTGAGAG ACTACGACCT GTTGCCGGAG 960
CCGCTCTTTG AGGTAGGAAC ACGCCCACCC TCACACACAC ACTTTGGACC CCTTATGAAA 1020
ATTAGCATTG TTTTATCATA GTGCACGTTA AGTAACCATA ATTTCTGACT GCTGTATTAC 1080
AATTTGTATA GCCACAGAAT GCTATTATTA CTATGCCTTG GTCAAACTGT ATAATAGTAC 1140
ATTTGTTTTT GTTTTGTCTG TTGTAAATCG ATGGCTTTGT TAAATACGTT AGTTAATTAA 1200
CCTTTTTTAA TATGAATTAA CATTATTGCT GACACTAACA CAACCCTGTT ATTGTTACCT 1260
TATTAATACC ATATATTTTA TCATGTTAAA TTAAAATACA AGTGCTTGTT TTAAAATGGT 1320
ACCATAGTAA AATTATTTGG ACAGTCAGCC ACAGCTTCCC AGTACTGGGT TGCAGCTGGA 1380
AGGGCATTCG CTGTGTAAAA CATATGCTGA ATGAGTTAGC GGTTCATTCC GCTGTGGTGA 1440
CCTCTGATTA ATAAAGGGAC TAAGCCGAAG GAAAGGGAAT CAATGAAGAA ATGTTTTCCA 1500
CTTTTGATTT CATCAAGCAC CAGCAAACCC AGAAAACTTA GCCACAGCAA AATAGGAAAG 1560
AAACGAAAGA AATGAACTGA ACTTTTGCAC GTTACAGAGT AATTCTTTTG CTCGCTGGAG 1620
AGTAGCAACT CTCTTGCACA AAA 1643