EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24572 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:23955407-23956923 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr3:23956608-23956619AATTTAATTAA+6.32
Lhx3MA0135.1chr3:23956885-23956898AAATTAATTAATC+7.82
PHOX2AMA0713.1chr3:23956607-23956618TAATTTAATTA+6.62
POU6F1MA0628.1chr3:23956887-23956897ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:23956887-23956897ATTAATTAAT-6.02
PROP1MA0715.1chr3:23956607-23956618TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr3:23956607-23956618TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr3:23956607-23956618TAATTTAATTA+6.62
ZNF384MA1125.1chr3:23956814-23956826TTTAAAAAAAAA+7.22
Enhancer Sequence
TGTGAATTCA CTTTCAGTTT TGAGCATGTT TCAAGATTAA ACAATGAACA CACAAGGTGG 60
AGGCGCGAGT CTTCCAGAAT GCTCTTCGGT TATCTTGACT GAAGCTGTAA TGATGGAACT 120
GTAGCCTATA ACACATCACC TTCATTAACA GCAGTCAATA ACGCGTGACA CTCCCGCTGA 180
CCCACTTTAT TATTTCTTCA TAACTGGGCA ACAGGCAGCT TGAGTCACGC AATGATGTAA 240
TAGTGGTGCG GGTTAAGAAA AACAAAATAA GCTACTACAT ACTTCAAAAA AGTACTAGAA 300
CATGTTTTTT TCCTGTCATA ACACAACAGG TGAGTGAGGT GACCCACACA CTCACAAAAC 360
ATGCACTGAC CTCATGAGTT ATACAGTAAT TATGTGATAA GGGTCAGGGT ATATTCTGGC 420
AAACCGTTTC CCAATCACGC TTTGCAATCG GCAAAGCAGA ACGGAGCACA CACCGTTTAC 480
CAATTCAGGA TGGATAACTC GCAAAGCTAA ACTTTCCTGC GTGCTTTCTT AACATATTGC 540
TATCAATCCG CATTGAAAGC AAGAGAATAT AAACGTAAGA GGCGGGGCAA GGGTTTACGT 600
TTTTCAAATT AAAAGTGGGC GTACGTTTAA ATGAAAAAAA AAAAGAAAAG ATATGCCTAA 660
TGTTAATGTG AAGTACAGCG CATTTGCGTC CATTCTATAT TTTTAAGCCT ACACTGAGTG 720
TAGGCTAGTA ATAGAGGGTA TTTACTTTTA GTAAAAAGAT GTGACAATAG CAGCACAATA 780
TTTAATTTTT AGTATTTTAA ATATATCACG GTGGTGCAGT GTAGCACAAT CGCCTCAAAG 840
CCGAGCCAGA TGGCATTTCC ATGGGGAACT TGCATGTTTT CCTTGTGTTG GTGTGGGTTT 900
CCTCCGGGTG CTTGAGTTTC CCCCACTGTC CAAAAACATG GTGTAGGTGA TTTAAGTATA 960
TATATAGTGA TGGGTTGCGG CTGCAAGGAC CTCAGCTTCG TAAAACATAA GCTGGATATG 1020
TTGGCAGTTA ATTCCGTTGT GGCGACCCCA GATTAATAAA GGGACTAAGC TGAAAACGAA 1080
TAAGTGATTC AATAAATGAT TAAAATATTT GCTCCTTATG GGCCATCTAA CGTAATCTAT 1140
TGCAAACAGT AGCAATTATC TGCAAGTATT GTAGCACTTT AAGAAAACAG TAGTCAATAA 1200
TAATTTAATT AAATACAATA CCAGTCATAG TTATAAAGAT GAACAACAAC TAACCTAATA 1260
TTCCTTCTTC AGATAAAATA ACTCATCGTA ACCTTCATAC TCTGACTATT TTTAATCCAA 1320
GTAGTCCTCT ATTTTTGTAC AACCAAGAGA TGACAATTTG GGGGAACAGA GTCAGAAGTC 1380
TTTTGTCAGA AGATTAAGAA ACTTTTATTT AAAAAAAAAG GATGTAATGC AATTTGACAG 1440
AGAAGACTGA ATGCACGAAT TAAGAAATTT CATTAATAAA ATTAATTAAT CGTTTTTTTA 1500
AATTTATGGG TTATTC 1516