EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24556 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:23583528-23584673 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr3:23584526-23584541ATTGTTTATTTTGTA-6.28
Foxq1MA0040.1chr3:23584525-23584536AATTGTTTATT+6.02
HOXD9MA0913.2chr3:23584288-23584298GTTTTATTGC-6.02
Hmx2MA0897.1chr3:23584518-23584535ACTATTTAATTGTTTAT-6.24
Hmx3MA0898.1chr3:23584518-23584535ACTATTTAATTGTTTAT-6.07
RarbMA0857.1chr3:23583990-23584006AGGGGTCAAAAGTTTA+6.26
RargMA0859.1chr3:23583991-23584007GGGGTCAAAAGTTTAC+6.52
SOX10MA0442.2chr3:23584660-23584671AAAACAAAGAA+6.62
Enhancer Sequence
ATACATTCAG GCTGTTTTCT CCTCCCTACT TCGTTTGACG TTTTCCCCCC TCAGATGTAA 60
CTCTCCTCAG TCGCCAGCAG AGCCCGCTTT AGACCAAGAT CATGATGATT GAGGTTGCTT 120
AGTTTTTGCT GGACGCCGTG TTTGCACAAA AGAATTAGCT CTAGAATATG TTATTTTAAT 180
TGAGAACACA ATACTATCCT AAATTCCACC ATATATACGT TGTAGTACTG TCCCCTGTGA 240
TGTAAACCAC CCTCAAAGGA TACAAAATGT GCCTGTGGAC ATTACATAAT GAGATAACAT 300
AGTTCAATGC ATTTGTAGGC AATAAGACAG CATCAAGATA TGGCTTAGGT AAAATAGAGG 360
CTCGTTTCCC CTCTCTGTGT CCCTAGTTTA ATCCAGAGTA GCGTGGAGGT GAGCCGTAGT 420
CTCGTTAGAA GTGGCGCGAG ATTTGGCGGG GTTAAAAGGT TTAGGGGTCA AAAGTTTACG 480
TAGTGCGTGA CTCGGTCGTT GGCTGTCGAC TCGCTGCGCT TGACCAATCG CTGGATGTCA 540
ATGGCAAAGT GGGAGAAAGA GAGAGAGGCG GAGTGAAGGT TTTAAACTGT CTCTTTTGAA 600
AAGATTAGAA AAATGACAGA AAGAGCAGTA CTGACTTTGC AACAAAGCAC GTTGCTGAAA 660
GGGTGTGTAG TGGAGAAAAA AAAACTATTG ATTCAGGAGG GCATCTGCGA AAAGGCCTGG 720
TGTTGCACTG TTGGTTTAAA AATAGTTCGT TTAATTCTGC GTTTTATTGC ATTTACTGCT 780
TATACTTTTG TGAGGCGGGC TATGAATGTT ACATATAAAG CAAGTGAAAG GCAAATATAA 840
CCAAACGTTT GATCAGTGTT CTATAGAAAT GTGATTCCGG TCGTTGTAAG TCATAGTAAA 900
ATCATGGCAG CTATCATGAC AGTTACCTGG TAAAACTAAA GTCTGTTGCT TTTATTAATT 960
TTATTGTGCT GTTTTCTACA GAAATGCTAC ACTATTTAAT TGTTTATTTT GTATGCTACT 1020
TTATTACTAT CTCTGTGTTG TTGGTCTAGG ATTGTGTAAA CCTATACATT TGTCTCAACA 1080
AAATAGCCAA TGCAGCTGCA AAAATATACA ACTGCAACCG CATAAATAAA TAAAAACAAA 1140
GAAAA 1145