EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24543 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:23450134-23451349 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr3:23450298-23450309ATAATTAATAT-6.02
POU4F1MA0790.1chr3:23450294-23450308GTGCATAATTAATA+6.66
POU4F2MA0683.1chr3:23450294-23450310GTGCATAATTAATATA+6.04
POU4F3MA0791.1chr3:23450294-23450310GTGCATAATTAATATA+6.3
Enhancer Sequence
CGTAGACTGT TTTGTTTTTA TTTATTTTGT CCTTTATAAA TGATTACTCG CAGAGAAAGC 60
GCGTAAATAA TGTTAAAGGA ATAGACTAAG TATTTCAACG GGTCAAAATT GAAACATAAG 120
TGAACTATCG AAGTTAAGCG AAATGTTGTG TTTGCACCGT GTGCATAATT AATATAGATT 180
TTTCCAACGT AGAATATGTG TCTGAATCTT TTCCTCGTTG TTATAATTAT TCTTTACTTC 240
AATCACGTTG AAAGAAAGCG AATAACAAAG ATTTAAAAGG CTTTAAACGG CACATTTTAT 300
TATGTGCATT ATAAGTTAAA TAAAAGTTTC ATTAATCTGT CTTAACCCAG ACTGTTAACA 360
AGACCATTCA AGTTGTTTAA AAGTGTTTTG TGTATTCGAC GGGTTTTTCA AATGTTTTGA 420
AAATGCTGCA ACAATCTGTT AATACAGTCA TGTTTACCTG TTTGTAATAA TTTTATTAAA 480
TAGATAAACA GCTCGCTATA ACGAAAGACA AGTCAAATCC AATACGAGGT ATATAAATAA 540
CTGTTCAGAG TAGATCTAAA GTATCCGCTT TCATAAATGA ATCATGTGTT ATGAACTGTT 600
AAAAAAGACC GTTTTCAGCG AAGTAATACA TTTGTAGTTT AGATACTGCC TTCATACTTC 660
ACAGTTAATC AGATGTTATT ATAAAGTTTG AAGCATGAAA GGAGTATAGG TTACACGCAC 720
TACTTTCATC TGCCCAGGAC CTAACTTTCC CCCACGACTT CCTCTTATAA CTTCCTTTTA 780
AACGGAATTT GGCTGATTCG CTCTTGTGTG TCATGAATTA TCCGTTCAGT GCGATGATTT 840
GTTGTTGTTG TCATGTTTAA ATTTAGTGTT GACACGCTGA ATGGTTTTAC TGTGGGAGTT 900
AGTTAGGTAA AAAAATTCTG ATTGCATTAA ACTTAATACT AGTGACGTCA TAAAACGTTA 960
ACTTTCTCCG CCCCTCCCCG GAATTTGAAC GTTGTCTTGG TAGAGTTGTG AAAGAAATCC 1020
TGCACAAGTC GCTGTTCACG GGGCAATGAT GTGTTGGGCA AGATTGAAGA CTATCAACCT 1080
AACTAAACAA ATATGTTAAA AGCTGAGTTT ATCCTTTAGG CTATGTTGTC TGAAAACAGA 1140
ATCGTGTAAA GACAATGTTT GTTTGCCATA AGTCAGTTGA GACCCAATCA AGAAGAATTA 1200
ACAAGTGATA GATAA 1215