EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24540 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:23430214-23431138 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BACH2MA1101.1chr3:23430818-23430832CCTGACTCAGCAAG+6.25
HNF1AMA0046.2chr3:23431069-23431084TGTAAATAATTAATT-6.38
HNF1BMA0153.2chr3:23431070-23431083GTAAATAATTAAT+6.42
Lhx3MA0135.1chr3:23431075-23431088TAATTAATTAATA+6.25
Lhx3MA0135.1chr3:23431072-23431085AAATAATTAATTA-6.71
POU4F1MA0790.1chr3:23431070-23431084GTAAATAATTAATT+6.11
POU4F2MA0683.1chr3:23431070-23431086GTAAATAATTAATTAA+6.39
POU4F3MA0791.1chr3:23431070-23431086GTAAATAATTAATTAA+6.38
POU6F1MA0628.1chr3:23431077-23431087ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:23431077-23431087ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
GCATGGTGTT TCGTGCTCGT TCGAGTGGTT TTCCACAAAT GCATGCAAAT AAAGAAATAC 60
CCATTAAAAC AAGTAGTTTA TTTAATGGAA TCATGTGCAA CTCCCATTCT GTTGTTTTAA 120
AACTTTATTA CAGTGCCTTT TTACTGCACT ACTCTCTCCG CTGTTATGCA GCAACAAATC 180
AGCATGCTTA ATTACATTAC ACTTCATGCA ACAATATTCC CCGTTAAATT GCATTTATCT 240
CAGCCACATC GAATTAATGG TGTCAAGTGT GAGGATCTGC TTTTACATCA CAGCCTGCAG 300
TGCAGCAGAA GCTGAATCTC ACGGGCTGGA TCGCTTGCTC GCACGCCGCG CTGTGGCTCC 360
AGCTCCTCGG CAGCAGTGAG GGGGAGACCT GCCTTCATTC ATAAAGTCAC CGGGCTACTC 420
GAGAGTACTA CAGCTCCGTG AAAGAGGCGG TGCGCGGCGT CACTGCACCG CCCACCCTGA 480
GGAACGGAGG GGGTTGGTGG AGAACAGATC TGCACGTTCA CGAGGAAATG GGGGTGTGTA 540
ACGGAACAGA AACTGTCTCA TACAGAACCG AGCATCCACG CTATAAGTGG CACAATGCAG 600
TGCACCTGAC TCAGCAAGGT CTAATAACGA TTTTGTCACG ATTTGCACCG CTTCCAGTGC 660
CGTTCTCTTT AAGAGCGCAG CTTATGGGTT ATCGGAGCAG CCTATGGATT TACCGCGCTC 720
TGCCATAAAG ATTAGCAAAC GAATAGATTC CATCATGTTC TGCTCATAAA ACGCGCCATA 780
AAAGAGCGGC AATCATTGCA GATAAATTAT TTCGTTTCAT TCTGAAGTGA TCGTGCACAT 840
TAGTTTATGT CGGATTGTAA ATAATTAATT AATAATTCGA TACTCTGAAT GTCTATGTTG 900
CGAGCTAATG TCATTTGATA TTTA 924