EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24539 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:23428195-23430168 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Hnf4aMA0114.3chr3:23428980-23428996TGGGTCAAAGTTCACG+6.7
NR2C2MA0504.1chr3:23428390-23428405CAACCTTTGACCCCT-6.18
Nr2f6MA0677.1chr3:23428980-23428994TGGGTCAAAGTTCA+6.15
RXRBMA0855.1chr3:23428390-23428404CAACCTTTGACCCC-6.16
RXRBMA0855.1chr3:23428980-23428994TGGGTCAAAGTTCA+6.69
RXRGMA0856.1chr3:23428390-23428404CAACCTTTGACCCC-6.4
RXRGMA0856.1chr3:23428980-23428994TGGGTCAAAGTTCA+6.77
RxraMA0512.2chr3:23428390-23428404CAACCTTTGACCCC-6.29
RxraMA0512.2chr3:23428980-23428994TGGGTCAAAGTTCA+6.64
ZNF263MA0528.1chr3:23428301-23428322GGGGGAGAAAGAGAGAGAGAG+6.49
Enhancer Sequence
ATTATCATGT GAAACACCCC TCCCTCTCAT CCGTCATCCT CTTTCTCGCT CTCTCTCTTG 60
CTCCCTTGGC CATTTGAGTG AGAAGGGAAG CCACAGGAAT GGATGGGGGG GAGAAAGAGA 120
GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA ATTTCATCTC ATCGACAAAG AGTTTTGTCT GCAAGTAGTT 180
CTCAACCTTG CATCGCAACC TTTGACCCCT ATGTGGATGG GGATTGCTCT GGTCAGGACT 240
TTAAAGAGCC ACAGGGCAGG GTAGGGCAGG GGACTGGGGT TACTAGCAAA CAATTGAACT 300
TTTCAAAGAG GCTGTAGATT ATGCTGAGGT ATGGCAGTGC TGTTAAAAGG GGGGAAGGGA 360
TTGCAGGACA TAAAACAGCA AATATTAATT TATTTTGTTA AATTTGTGGC ACACTTCATA 420
TACAAACTAA GAAATCAAAA TATAAAAAAT AATCCTGCAC TAAAATAGGC TAAAAAGGTG 480
TTGTCTAAAT CATAATTCAT AAGTAATAAC AGAAGGCACA TTGTTTAAAT GTTTTATAAG 540
TTGAGCACAA TATGTAGCAG ATAATCTCTA TTAGGCTTGT GCGATATTTA CGTAAATCGT 600
GTGTAGCCGA TGAAGGGTAC TCAAGTGAAA AGCTGCATGC GTGTTTGCGT CTTTCCAAAA 660
ATTACATATG TATAAGCATT ACCCCCTCCG GTGGAGTTGC TTTTATGGGT GGTATGTGAG 720
AAACAACTGT AGATAGCGAC AACTCTGGGA TCCGTTTAGT TTACAAAGGC GATATGCCCT 780
AAGTTTGGGT CAAAGTTCAC GCTTTGCTCT GCTGTGGAGA AGATGGAAGC GTTTGTGCGC 840
CTCCATTTTG TGACTCACGA GTAGGCTAGA ACATGGGACA GCATGACTAA ATCGAGTAAA 900
GAGACGCAAA CTGAACACAA TACGAGCAAA AAATTAATGC ATCGGTTAAA TTCACGCTCA 960
AAGTTATTTC ACATAAAAAA ATCGCTCGAT TTATGAAGAA ATCAAGAAGA CTGACGGTAA 1020
ACCAAGGCGG CGTAATTTGA CAAACATCAC AATGAGCTGT GAATACAGAT GTCTGGAGGA 1080
CTTTTGTACG TTAATCAGTT TTCTAAACTA ACCAGTGACA TAAAATCGAC TTGTATTGAA 1140
TATTGTACCT GTAAGCATCT ATAATAAATC TGAATAAAGT AATGCCACCC TCCCCCTGCC 1200
TCGCATGTTC GCCATTTCAT GAGCCAAGAG TTCAGGAAAA AAACGAAATG GTAGGTTGCA 1260
CTCCAAAAAC ACACTTATTC AGCCTCAAAA CACACGCATT TATATTTCAG AAAATACAAA 1320
ACGAATGTTC ATAATTTTAT AAATGATCAC ACGAGTTTTT TTGTCACGCA TATTTGTAGG 1380
CGCTCACTCG GAGTGGCGGA GAAACTTACA TTTTATAGTT ATTTGACTTT AAAAATAATA 1440
ATTAGGGCAT GCATGGTGAG AATCACATTT AAAAGTGGTC AAATATAAAA TAAATAAAAT 1500
ACACGTTTAC TAAATTCAGC CAAATTAAAA CGTTGACAAA AAACACCATC ATTAGAATTT 1560
GGTCACGCAA TTCTCAAGAG AATTTATGGT TTTAAACCAT ACCCACAAAA AATAAAGTTT 1620
ATAAACTGTT CATGGATTTT GATTATACTG TAAATCGTTA AGCACACAAT AAAAGCATGT 1680
TAAAACAATA TAATTAATTG CGTCCTTTTA TAGCAGAGTC TTTTGTTGTT TTAAAATGCG 1740
CTCTTATATG ATCCACTGCG CACATGGGTT GCCTATACTT GATGCACAGC ACTCATAATT 1800
TCATTATCTC GTCAAACTTC AAAACCAGCA GGAAATTCTA GTTTACAGTG AAGAAGTATA 1860
GGCCTGGATT CGTCTCAAGC ATGTGGGCCA GTGTACGTTC AGCTCTCTGA CAACGCCCAA 1920
TTACCACAAT GAATCTGTCA CATGGGCAGG CGCAGAATGT GCTAGAAAAC TAT 1973