EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24534 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:23343000-23344014 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ETV6MA0645.1chr3:23343838-23343848CACTTCCGCT-6.02
HOXC13MA0907.1chr3:23343708-23343719TTTTTACGAGA-6.02
PAX3MA0780.1chr3:23343307-23343317TAATCGATTA+6.02
PAX3MA0780.1chr3:23343307-23343317TAATCGATTA-6.02
PAX7MA0680.1chr3:23343307-23343317TAATCGATTA+6.02
PAX7MA0680.1chr3:23343307-23343317TAATCGATTA-6.02
POU1F1MA0784.1chr3:23343053-23343067TTAATTAGCATAAT-7.04
POU2F1MA0785.1chr3:23343055-23343067AATTAGCATAAT-6.44
POU3F1MA0786.1chr3:23343054-23343066TAATTAGCATAA-6.92
POU3F2MA0787.1chr3:23343054-23343066TAATTAGCATAA-6.92
POU3F3MA0788.1chr3:23343054-23343067TAATTAGCATAAT-7.52
SPI1MA0080.4chr3:23343838-23343852CACTTCCGCTTTCT-6.77
SPIBMA0081.2chr3:23343838-23343850CACTTCCGCTTT-6.92
Enhancer Sequence
GGTTGGGTTT AGGGTTGGGG CAGGCATTTA AAAAAAACTC TTTAGTGGGT TATTTAATTA 60
GCATAATTAA TAGTGGTTAC AATTACTGCT TTTACAGTAC TGTTACGGTT GGGTTTAGGG 120
TAGGGTTAGA CATAAATAAA ATATAATAAA TGGAAAAAAT AATATAAATA ACTTAACTTC 180
CGACCACAAC CATATCCGAT CTAGCAACAT CATACTGACC TCAAACGTTT GAATGCCACT 240
GTGTAGGTTA CTTTATGTAC AACATTATAA TTGCATTACT GAATAATTAC CTCTTGTATG 300
GTTTAAGTAA TCGATTAAGT AGTACGCTTT GGTTTTCATG CCTTCATGTA TGCCTTTACA 360
GACTGTTGAT ATAGTGATTT GCTCGGTTAT ATTAACAGAT TCTTGCACCG TCGACGGGAC 420
AAAACTTCTG TCATCTGCGT TATAGTGGCC GATCACAATA TCATCCAGCA TTACAACTGC 480
ACTGAACTCT GGGAATTGGA CTGAGATGTC TCCTGTCAAA AATGTAGCGA AGACCCAGAG 540
CGAATGTGAC CCTGTGAGAA AGTAAGTAAA GAGCATGCAA TTAATAATGA TTTTACTTTA 600
TCTAAAAAGA AATAAAAAGC GAAATAGAAA TAGTGCTGTG AAACTTACCT GACTGAGAAA 660
ACACTGAGGC TGACAGTATG CACACTGCAA GGACTAAATA CATCATGTTT TTTACGAGAT 720
ATTAAAAAAG GTTAACAATT TCTCGATTCC AGCATTAAAA CTAATCTATA GTATCAGTTT 780
AGGCATAACA CTAATCTTGT TTATGCTTGC CATGCAGTTA TTCAGTACCG TGGTGTTACA 840
CTTCCGCTTT CTGTTCTGTA TGAAGTTGTA CTGTAGTTCA TTCAGTAAGT TTGGTTTTAA 900
CACGCGTGTC CACTAGAGGA CGCGAACACA CCGAGGCAAA ACTTAATGTA AAACCTTCAG 960
AGTTTTCGCC CACAAAAATT GATATCAAGT TAGAATGCTG TTTTTGTGAA AGCT 1014