EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24472 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:20988499-20989759 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Hmx1MA0896.1chr3:20989531-20989548ACTAGCAATTAATTGGT+6
Hmx2MA0897.1chr3:20989531-20989548ACTAGCAATTAATTGGT+6.3
Hmx3MA0898.1chr3:20989531-20989548ACTAGCAATTAATTGGT+6.33
MIXL1MA0662.1chr3:20988740-20988750GTTAATTAGA-6.02
NHLH1MA0048.2chr3:20989394-20989404CGCAGCTGCG+6.02
NHLH1MA0048.2chr3:20989394-20989404CGCAGCTGCG-6.02
PKNOX1MA0782.1chr3:20988631-20988643TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX1MA0782.1chr3:20988631-20988643TGACAGCTGTCA-6.92
PKNOX2MA0783.1chr3:20988631-20988643TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX2MA0783.1chr3:20988631-20988643TGACAGCTGTCA-6.92
TGIF1MA0796.1chr3:20988631-20988643TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF1MA0796.1chr3:20988631-20988643TGACAGCTGTCA-7.22
TGIF2MA0797.1chr3:20988631-20988643TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF2MA0797.1chr3:20988631-20988643TGACAGCTGTCA-7.22
Enhancer Sequence
TACACTTTGT ATAGATGTAA CACTACTATG AACTATAAAA TGAGTTTTAA ATATTTAAAA 60
AGTGAAAGAA ATATTACACT GACGCTGATA AAATAATAAA TATTAGCCTT ACTTCAAAGT 120
ATTTATAAGA CATGACAGCT GTCAGTCACA GTCTTTGTTA TTAAAGCCGC ATTGTGACAT 180
AACAGTGGCC CATCGTGCTG AAAAACACCA TATAAAATAC ATTAATTCTG CACGTTTTCT 240
TGTTAATTAG ACCACTGTGC AAAATACTTC ATGCGGAAAA AATATATACA TCATTAAGAT 300
GGCTGTTTAA TGTTTCATTT GCCGCAAGCG GTCGCATGGC GTGAATAAAA TGCCATCAAA 360
TTCATTATGA GATTCTCCAT CCAGGCCCCA GCGGCGTCCG CGCGAGCCTC GGCGTTGCGT 420
TAAATCTCAC GCGTGTCTGG AGAGCGCTTC ACCGGTCGTC GTCCATGGCT CCGCCTCGGC 480
ATTTCAATCG GGAGGATGAC ATTTTTTTTC TTTTTTTCCC AGCAATACTC TCACCCTCCC 540
ACCCTCGCTC TTTCTTCCTT TTCTTTTTTT ATCCCGTCTT CTCTGCCCCG CTATCTCTCC 600
CCCACCGCCG TGTCCCCCTT GTTTTAAAGG GATAGTATAT TTTGAGTGAA CACCCCCTCT 660
GTGTCTTCGT CCCCTCCTCC ACGCGATGTT CTCGAGCGCG GTGTCTCCCC TCCGGCGCTC 720
GGGTTCGGCC GACGCAAATT ACAACATAAA CATCGAGATC AGTCAAAAGA AACCATCCGC 780
GCGTCCCTCT CCAAAAACGC CGGTCCACAA CGCGAAGATT GTCGGGCGTA GACAACTGGA 840
TGTTCGTATG GGGGAAAAAA TGTCGCAGGT CCTTAAAGGT AAAGACGCAC GCAGACGCAG 900
CTGCGGTAAA TAATAAGCGG CTCCAGATCA CTGCCGATAA TAATTGTTCT CGCCCAATGG 960
GATTAAACAC ACATGTCAGT AAATATCAAT CTCACAACCA AACATATAAA TGTAGATTTT 1020
GCTTGCCAGT ACACTAGCAA TTAATTGGTT TCCCAGTACG TCAAAAGCTT TGCTATCTAA 1080
AATGGAAGTT TGTTTAACCG TTGTACATCA CATCAACATC ACATCTTGTC TGGAGAAATT 1140
ATTGATTTAG TCATGGAAAC TGAAGTCAGT GTTCTTGTAA CTTTTGCAAC TGATTGTTCT 1200
TTTGTGCCTC TGGGAGGAAT AAATATATTG TCCTGTTTTA ATTTGATGAA TAAAGTTGTT 1260