EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24468 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:20860187-20861659 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Ascl2MA0816.1chr3:20860522-20860532AGCAGCTGCT+6.02
Ascl2MA0816.1chr3:20860522-20860532AGCAGCTGCT-6.02
NFYAMA0060.3chr3:20861283-20861294TCTGATTGGCT-6.32
Enhancer Sequence
GTGTAAGTGC AGATCACTGG AATGTGACAG TTGTAATTTG TTTTTCCTGA TGCTGCCTGG 60
CCTGCAGATA TTTAAGCTGA AGCAAAACAG ACCTCTTGAG CACTGGTGGA CACACACACT 120
TATAAGCTGA ACAGTGGACG AGAGAGCTTG TAAAACACCG CAGGCAAACA AAAACACCTA 180
AAACAGACAT CAGAAATGTT TTGATACAAC AGACCTGCTA TGTTTGTTCA GTCCCATGCC 240
ATGCTTTGTG AGCACAAAAC ATGTAGGGAA TAAGGTGGGG GTCGTTCAGT GCACTGGGAA 300
ATTTCTTGAA CACCGTTGAC TGAAGCCATT CAGAGAGCAG CTGCTGAAGC ACATACATCT 360
GTAGTTTTTC CATTCACGTT ATTATTAACG TACCATTTTC GGTTATTTTT AATAATACTG 420
TAATAGTTCT AACCACCAAA TGAGAAGTGT TCAAGTTGAT AGGAAAGTTG AGCATACTAC 480
CAAGTAAACA GCAGGTATTT GTGAAGTGTT TTTCGTGTAT TTCTTGCGGT TTTTACCTGT 540
TTTGGTGTCT TTGCAGCGCA GTGCTGTTCG GTTCTGCAGC TGAAACGGAA CCGTGGCTCG 600
GAGGGGCTGC AGTCCTTGAT TACCCACCCG GGCCACTCCA CTCCGACACG ACATTCCCAG 660
TCGCTTTTGT GCTCTTAAAA AGTCTTTCAA AAGTTCACGA ATCTCGCAAA CTCCAGCGTT 720
TGCCCACAGC TGACACCTCA GGAAGGTTTT CCGTCCAACT CAGCCGTCAA AAATAAAGTT 780
TCTATGCAAA TATTTTGATT TAGCTCAGTC GCTAGCTAGT CAGCTACTTT CTTTTGTCAT 840
GGTAACGTTA GTTAAGTTGT TCTAAACTAA CTAATTTAAC GAAATGCGGT ACTGTTACTG 900
TGTGATTAAC CATCTAAACT TCATATGCAC CGTCCTGAAC GGTTTATTCC ACTTGGCCTA 960
GTAAACTTAT AGCTGAGGAG CAGAACTTCA TTGTATGGGC TGCTGCCAAT TCTTCAATGC 1020
ACAATCTGAC AACAGCCAAC CTACACGCTC GTGTCGGATT CAGAGCACCG CACAGCGTCT 1080
AAACACATGT TTCTACTCTG ATTGGCTGCG GGAAAATACT ACTTACTCTC CATTGGTCGT 1140
TGAAAGCATC GATCTCATAG GGGCGGTTCT CATATTTGGC TTTCCACGCC CACTTCATTA 1200
AAATTCAGGC TTTCCACAGA CTTGGAGAGT TCAGCCTCCA GCAGAGAGAA ACACAATGCG 1260
TGGTAAGTTA CTAAATGGTC TCCCGAATTA AAGAAAATTG GTATATTAAG AGAAAACTGA 1320
ATTATGTTAA AATACAGATA TATTAAGGCT TTTAATTTGA CATTTACTGT CCTTAATGGG 1380
AATTTATGAA TGGACGGTCG GCCAATATAT GTTTTCCAAT GTCTGACGAC TAGAAAGTTA 1440
GGCCTAGAAA GCAGAGGGGC CATAATAACC AA 1472