EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24460 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:20642718-20644314 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BARX2MA1471.1chr3:20643519-20643531AAAAATCATTAC+6.37
FOXF2MA0030.1chr3:20643445-20643459TAAACATAAACAAT+6.64
NRF1MA0506.1chr3:20643221-20643232GCGCATGCGCA+6.32
TCF3MA0522.2chr3:20642796-20642806AGCAGGTGTT-6.02
Enhancer Sequence
TGAGTATGTG TACTTCTACT TAAGTAAAGG ATGTGTGTAC TTTTGCCATC TCTGTATTTA 60
ATCCCCCAAA AGTGTCAGAG CAGGTGTTTT TGGTGGTACT GAACAGATTT CATTGTCCTA 120
GTTGACTAAT ATTAATTGTG GCAAACGTGT GTGTAACTCT TTCTGCAGCA CTGATGAGTT 180
TTAAGTAAAG TGTGTTCGAG CAGACTCAAC ATAACATCAC ATTTTTCAGA ATAAATTACC 240
AGCTGAGGAC CCAGATCTGA TCTGAAACCA CCCCCACAAA GCATCTCTGA GTGGCATAGA 300
AAGCGTTCCG CTTCACAGGC GCCTCAAGCA GTCCAACTTG TCAGTTGTGC CTAATTCCTG 360
CAATGCAGCA ACCCATTCAA CACGTCTGCG TGAACGCGAT CATGAACGCG GCTCACTCCT 420
GGCAAAGAGC GCCCCTGCAG CGCTGCACTG CGCACGCGCA CAATACCAGC CCAGTATCTG 480
GCAGGATGCA GGACGTGTAG ATAGCGCATG CGCAAAAAGA GCCTCCCATT CACATTCAAC 540
ACGGGATCAG TATTTGGCCA AGCTTCTGTC TATGATACAC AGGCCTCCCA AAACAACTTG 600
GAAGAATTTA CAACAATACT CTAGTACTGC AGTAAACATG ACAGGGACCC AAAATAACAC 660
AATAACCATC TTTCAACGCC ACAATGAGAA AAGTTACGCA ATAAATGTAT GTGTAAAACT 720
TTCTTAATAA ACATAAACAA TATAAACACA GCATACTGAA GCAGGTGGAG CCAGTGTGCT 780
AATTTACATG ACAGTTGTCA CAAAAATCAT TACTTACTCT TTAAACCTTC AGTCGCTGGT 840
AGATTACAAA AAATAACCAT TAAAACAGAA AAACGCTCTG TTAAAACCAC ATCAAATATA 900
TGTTTTTGTA TTATATAAGA CTGATAAAGT ATTAAGGCTG GCAAGCGCAA CAAGAGGCTA 960
AGCTAGTTAG CACCACAACA GCAGCTTAAC ACTAGCGTAA ATATTACCGA TTTAAATCCT 1020
CGAACTCTGC AGTTCTCACT TTAACGAAGC TAAATAAGAG CTGAAACAGA AATATAACAC 1080
CTCCCCTGGT ATGTTTTGGA GTATAAGAGT TTATACACTT ACCTTTTTGG AAGATAAGCT 1140
GTTTTACCGT ATGGGATATT TTTCTATGGA GCTGCTTCAC GTCCGGGTTA AATGAATGAC 1200
GGCAGACGGG AGTGCGGACG TACTCGGGAG CGCGCGCTGT GCGGTAGCTG TCAAACCACA 1260
TTTGTGCATT CAGTTTACAT CTGAATGGAA TACATTCAAG GCTTGACATT AACTTTTTTT 1320
TACATTACTA GCCACTCGCC ATTTTCACTA GCCACACTTT TGTTGTTGGG AAAATATATT 1380
TTATATGTTA ATGTTAAGCT CTGAATAAAT GTATTATTTA TAGGCTTCGT TGTAGTCATA 1440
ATTTTTGAAA GTTATTGTAC CTGTCATCTG TTTATTTCAT TTCAATGTAT GAGTAAAGAG 1500
GATAAATGTA AAAGTATAGT CTAACTTTAT AAATATATAT TTTTATTCCG TGTTTATTTA 1560
CCAAAAACAA CACTAACATT ATGGAGGACG AAACCT 1596