EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24405 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:17783110-17784400 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr3:17783835-17783852ACCGCTAATTAACGGAG-6.3
IRF3MA1418.1chr3:17783443-17783464CAGTTTCCGTTTTATTTCCTG-6.31
MEOX1MA0661.1chr3:17783838-17783848GCTAATTAAC+6.02
Rarg(var.2)MA0860.1chr3:17784010-17784027TGACCTCTGCTGAGCTT-6.62
Enhancer Sequence
TATGTTTGTC GACATTTTAC TCTGTAATCT AATTTGTATT ACTGCATTGC CCATGTTATA 60
TACGCATGTA ATTGTATGAC AATAGGTAAC TAAGACCCTG TATTGCCATC TTTTGCGTTC 120
CTTGTATCGA CCACCTAATA ACTCACATTT AGATTAGTTC ACAGTTCAGA TTAGTTCACG 180
TGAATAAAGC TGAATATACG GCATTACGTG AGAATTAAAC CCATCCGGAA TGAGGCTCGC 240
GGGAGCGCGC TTAAAATCAG CCCCTGTTGA GAGCGTGTGT GTGATCTGCC TCTCCCTTCC 300
GCGTCCTCGT GCACGCAGCA GCAGCTCAAG TGCCAGTTTC CGTTTTATTT CCTGATTATT 360
GCTAGTCCTC GGAACGGACA GGCGGGGGTT TCTGCAGCGG AGAAACGTGG AATTTGGCCG 420
AACGGCGCTT TTGAACCTTC AGCTTCGGGA ACAGTGACAG CTTTTCTACA TCTGCCAGCG 480
TTATAATCCA GTGAGTAAGT TAGTGTTTAC GCAGTTTTTA ATCACATTTC CCAACCAAGT 540
AACGTTAAGT TTGATTATAT AAATGTATAT TGGTTTTTGA AACAACGTGT TTAGGTGTAA 600
CACACAAAAA TGGCCTGTGC TTTTTCTTTT TCCAGATGCG CGGGCACTGC CACGCTGATT 660
TGTTTTGTCT GCATGCAGCG TGGTCGGGCA CTGCCACTCC CCGAAACGCC TGGCTTTGCA 720
TTGTTACCGC TAATTAACGG AGTTCTCATT TAAAACGTGT TCATTGTAGA TTTAGGCGTT 780
GAATTGTATT TAGTGTAATT TGTGCTTATT TTGTAAACCC ACGCTCAAAT ATTCCCTGAA 840
GTTGTCTAAT AATTGCGTTT TTGGATGGTT CAGTCTCGTT ATATCCCGCG TGTAAGTGCT 900
TGACCTCTGC TGAGCTTGGA TGGTCACCAC TGTGAGTCCG TCTGCTGGGC GTTTGGGCTC 960
TTCTTTGTCT TCCACAGATT AGGTGGCGTG TCCGAATCTA ATTTGCTCAC ACAAAGGGTG 1020
CTTATCAAAG CCCACAAGCT GCCTACATAG ACAGCATTTG GACTTCACGT TTGCTTTTCT 1080
GAAAGTGCTT AGCAGGCAGC ACACTTAAAG GCATAGTTCA CGCGCAAATT AAATTTTGCT 1140
CTCCCTCAAG TGCTTGTACA CCCTTTTAGA AGTTTATTTA TGAAGATATC CTGAAGAAAG 1200
CTTTAACCAT TGACTTCCAT AGTAGGGAAA ACAAACACTG GAAGTCGAAG GTTGCAGGCT 1260
TTCTGCTTTC TTCAGTATAC CTTTTGTTAA 1290