EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24383 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:16621730-16622693 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUX4MA0468.1chr3:16622512-16622523TAATTTAATCA+6.62
DUXAMA0884.1chr3:16622511-16622524ATAATTTAATCAA+6.98
FOXP2MA0593.1chr3:16622680-16622691AAGTAAACAAA+6.62
GFI1MA0038.2chr3:16621858-16621870TGCAGTGATTTT-6.11
POU3F2MA0787.1chr3:16622532-16622544TAATTTGCATAC-6.04
Pou2f3MA0627.1chr3:16622530-16622546ATTAATTTGCATACAT-6.74
Enhancer Sequence
GGGGGAAAGG TATCTCAACA TTTAAGTTAT TAGTTCTATT TATTTATTAG GCGATTACCA 60
ATGTGTTAAT GTTGTCAATG TGATAATATG TTAATAAATA ACTTGTAAGT TGAGCAAGCA 120
GGGTTAGCTG CAGTGATTTT CTATGCAAAT AAATACGCCA AGGAGGAACG TCAACTCAAC 180
TGTCATTTTT GAAATATTAC CCGTTAGCGC AGCGCCATCT TGTGTTGTGT CTCAGGGAAG 240
CTTCATTGCT CCAAAAACCA GACCAGAAAT CAAATGCTCC TCTGCGGTAA AGTTGGTTTC 300
CACTACTACA GGGATTAACT TGGACTCGTT TAATTTGTGT TTAATGGCGA TCTTGGATTC 360
GTTGTTTCGG TGGTGAAGAG ACGTCGCATA CCGGCGGTTC GAGCATACTA AATAAACGAC 420
AAATAATCAT CAATGAAAAG TTAGAAGGCA ATAGGCGCAA CACGGCAAAT ACAGCGTGCT 480
TATGCGGTAA AAACCACAAC AACAGTCCTT ACGGGATTTC TCATCTGTTC TGTCAGGTAA 540
ATATTACCTT TTTTATTAAG TTTCTAAGCT TTATATGCAA CCACTTTTTG TACATCCCTA 600
AATTTTTCCA CTGCTGCATT GAATCTTTTG AATTAGTTTG ATGGCAAGAC ACTGCAGTTC 660
AAAAGGGTAA AACTAAAGGT AATAGTTTTC ATCAGACTTC CACAGTTTAT TGATAATGTT 720
ATGAAAGACC ACTTTTTTGT TACAAGTTTT GTAAAACGTT ATTTGAATAT TCAAATGGGG 780
CATAATTTAA TCAAATTTGA ATTAATTTGC ATACATTTCT AGCACAAAAA AATCTGAACA 840
TTGGATGAAG TCCGGATAAA TATTCTTGTT TTTTGACATA TTACAGTCAA CCGTTTGTAC 900
AGAAAGGATT TTCAATCATG ATTGAGAATA TAAGTGATCC ATAAAAAAAG AAGTAAACAA 960
AAT 963