EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24364 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:15982339-15983898 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr3:15983009-15983020ATATTAATTAT+6.02
FOXA1MA0148.4chr3:15982943-15982959GCATATGTAAACAAAC+6.32
FOXC2MA0846.1chr3:15982946-15982958TATGTAAACAAA+6.74
FOXK2MA1103.1chr3:15982947-15982958ATGTAAACAAA+6.32
FOXP2MA0593.1chr3:15982947-15982958ATGTAAACAAA+6.14
Foxj3MA0851.1chr3:15982944-15982961CATATGTAAACAAACGA+6.15
Gata4MA0482.1chr3:15983221-15983232AGGAGATAAGA-6.14
RFX2MA0600.2chr3:15982918-15982934CGTTGCTATAGCAATG+6.04
RFX2MA0600.2chr3:15982918-15982934CGTTGCTATAGCAATG-6
RFX3MA0798.1chr3:15982918-15982934CGTTGCTATAGCAATG-6.11
RFX5MA0510.2chr3:15982918-15982934CGTTGCTATAGCAATG-6.34
RFX5MA0510.2chr3:15982918-15982934CGTTGCTATAGCAATG+6.3
Enhancer Sequence
CAGGATTTCA GTAGATCAGC AGTTTCTGAA ATACTCAGAC CAGCCCATCT GGCACCAACA 60
ACCATGCCAC GTTCAAAGTC ACTTGAATCA CCTTTCTTCC CTAATCTGAT GCTCAGTTTG 120
AACTTCAGCA GATCGTCTTG ATCATGTCTA ACGTTATATG CCTAAATGCG TTGAGTTGCT 180
GCCATGTGAT TCGTTGATAA GAAATGTGCG TTAAGCAGTT GGAGAAGTGT ACCTAATAAA 240
GTGGCCGGTA AGTGTATATT CCTTTATCGA TTGTTTTCCC ATTTACTTAG CATCCTTTCA 300
GTATCGCCTT TTTTTAGCCA CGTTGAAACA GAAACGGTCC CTTTCGCTGC TTCTTTCTTC 360
AGATTTTCTT TAAATTTTTT CCCTCTTTCA TTTGAAACTA GCTTTACGTT ATAACAAAAA 420
GAAAGCGGGT AACTTACATT AACACATGCC CTCTTAAGCT ATGTTTAAAA TCTAAGTTAA 480
GCAATGACGC TAAACACACA ACTCACCTTA AATGTCCGTT TTGTTTTTAT CAAGGTAAAG 540
CTTAGCTAAG ATAAATAGTA GCAAAGCTAC TCGACGTCAC GTTGCTATAG CAATGGCGCC 600
AGAGGCATAT GTAAACAAAC GAATTTCGTC TCGAGTTATT GATGTTCGTT GCTGATTTTC 660
TCGTGTTCTT ATATTAATTA TCATAAGTTA AATGCATTTT GTTTGTCTCC GTGTTTTGAT 720
AGCACTTTTA ACTAGTTTAA AAGGGGGAGG GGTGCTACCT TGAACATAAA GCCTAAGTAC 780
AAATTCAGTC AGATGCATGT CAAAAGATCT CTTTTGGCCG TTTTCAAGTC GTTAAGAAAC 840
TGTTCAGAAC AAATGCATTA GCACACACTG GTCTATAAAA GGAGGAGATA AGATTATCAT 900
CTGAATGATC GATGCAAAAC GACCTACAGC TCAGCTTCTG TTTGATCTGA TAACGATTCA 960
TTGTCCTTAT CGGGCTTCGT CTGCACCTCT TTTCAACTTT TCTTAGAGCT TTTTTCTTGT 1020
TTTTAGTCCA AATATCTACA CTACCTGACA AAAGTCAAAA GTTTTAGGAA CAACAAATAA 1080
TAAGTTGACT TCTAGTTGAT CATTTGTTAT CAGAAGTGGC TTATATGAAA GGCAAGGGCC 1140
TCTAGATTAC TCTTATGTTA CCAATATAAA CTATGATCAT GCCTTGATTT TTAATTATTT 1200
TATTAGGACT GTAAGATCTG ACTTTGCTTA GACAAAAGTC TTGTCACTTA ACAGAAATGT 1260
ACAGTTTAGA ATATAAAGTC ATGCTGCAGT GGAAGAAGAA TTAACATTGT GTATGATTCC 1320
CATGAGCTTG GAGGACTGCA TCCATACATC TCTGCAATGA CTCAAATTAC TTGTTAATAA 1380
AGTCATCTGG AATGGCAAAG AAAGCGTTCT TGCAGGACTC CCAGAGTTCA TCAAGATTCT 1440
TTGGATTCAT CTTCAACGCC TCCTTCATCT TACCCCAGAC ATGCTCAATA ATTTTTATGT 1500
CTGGTGACTG GGCTGGCCAA TCCTGGAGCA CCTAGACCAT CTTTGCTTTC AGGAACTGT 1559