EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24357 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:15708232-15709298 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
SP1MA0079.4chr3:15708246-15708261TAAGCCCCGCCCACC+7.09
SP2MA0516.2chr3:15708245-15708262ATAAGCCCCGCCCACCG+7.96
SP4MA0685.1chr3:15708246-15708263TAAGCCCCGCCCACCGG+6.18
Enhancer Sequence
AGAGAACCGG ATCATAAGCC CCGCCCACCG GCGATCAATT TAACGGCCAA CACCTGTTCT 60
GTTGTGTTCA CGCCAGAAAC AAGCGCCGTC AAAAGCAAAA ACAAATGCTT TAATAATGGT 120
AAATACACTG GATACACGTT AAGTTTTATA ACATGCTCTC ATTGGCTTGA GTTGGACTAA 180
AACCGGACAA TTGAACAGCA AATGACCTTT TGAACAGCTC GTTTGTTTAT GAATAAGTTA 240
ACGTTACCTG CACAAGCTTT ACAAGAATTC CTACGTCAGA AGGTGGATAA CGTTATTTTT 300
AATGGCGTCC CATAAGATTG CATGTTTGGA GCATTTGTCT GCAGATTGAA GAAACCTTTG 360
CTGAAATATG AAGTGAACTG AATTTTGACA GCACCTGCCT CATAAACTGC AGGTAAGACA 420
TTTATTTATG CTTTCTATGT AACTTAAACG ACGGTTTCTA TATGGTGGTT GTGTGGATAA 480
TATTTTATCA ATCATATCTG TAATCATTTT AAACAATTTG ATCACCAGTC GTAAAAGCCA 540
CCCATAAAGC GAATTATTGC AGATATCAAT GGTCAAAACG AGTGATGTCA AACGAAGTAA 600
ACACGGTAAA GTCTAGATAG GATACAGCTG CGCATACGCA CATCAATATA GTTAATAAAA 660
TACAATGTAT TCCGTAATTT AATAAATAAC ATGCATAATA CTTGGTACAA CTACTGTTTT 720
ACATTGCTGT GACGTTTGTG TTATTGTTAG ACGTTAATAA AATACAATAA ACGGGAAATT 780
TAATGAATAA TTCTTGCTAA CTTCTGACCT CAACCCGTAT CTGATCTAGC AACAACCAGG 840
TAACTTAAAC GCGTCAAAAT AAATCCACAT CATGACTCTA ATGTTTGGCA TCACGAGTTA 900
AAATCTAAGT AATAAACTGA CTAAAACTGT AATAAAAATA AAGCTGAATA TAACACTTTG 960
TAAATAAGAT TGTGAGTAAA TCAATGTATG AATGACCGAT TCACTATAAA ACCTTTAAAA 1020
ATAACACAAA AGCTAAATAT ACAAATAAAT ATCAACTAAT ATAACG 1066