EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24344 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:15289282-15290437 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr3:15289466-15289481AATGTTTATTTAGTC-6.3
Hmx2MA0897.1chr3:15290323-15290340GTAAGCAATTAATGTAT+6.33
Hmx3MA0898.1chr3:15290323-15290340GTAAGCAATTAATGTAT+6.23
SP2MA0516.2chr3:15289710-15289727TTCCGCCCCGCCCACTT+6.44
Enhancer Sequence
TTAAGCCTTT AAATGTCACT TTAAGCTGTT TAGAAGTGTC TTGAAAAATA TCTAGTCAAA 60
TATAATTTAC GTCTCAAGTT AGTCTGACGA AAAAACTGAT GTTGGCGAAG ATTAGGCTAC 120
ACGCATTATC TATAAATTAC TGGTCGCACA TTCAGTTCTT AAAATGCTAA ATTATGGATT 180
GAGAAATGTT TATTTAGTCA AAAAGAGCTG ACTGTAGCCT GGCTTCGTTT AAAATGCTGT 240
ATATTGATTA TAAACAAAGT CTATATGCAA GACATGTCAC TCGTATCGTT TTGAATGGGG 300
AAAAGTGTAA CGGTCAATTT GGCGAATAAA GCCCGCCTTC GAGTACAGAA GCCAATCATC 360
GATCGCTATA TGGGGAACAA AGCCCGCCTT CTAGTACAAG AGCCAATCAT TGATCGTTAT 420
TCACCTTATT CCGCCCCGCC CACTTTTTAT TCTTCGCTCT TCCGCATTTT GTCATCCAAC 480
TTCCGGTACG CTGACACAGT TCATCAGATT ATTGTTTCAG ATTTTAGAAA AATGGCATTT 540
AATGTTAGTT CAGGGAATGT TTTGAGCTGG GAGTACGGTG AAACCTCACT ACAACGATCG 600
GATGGTCTCA TATTGCCCCA TCCATCTTCA CCGTTAATGT GGGTAGACGA TATGAAAAAG 660
TGGCCAGAGG TAACTTACGG GGATATTTTC AATTACTTTG TCCTGTCACA AGGAGTAGAT 720
GGAGCGTCTA TGAAGAATTA TAAAAGTACC GAGGCCTACC AATATTTGCA TAGTGGGAAA 780
GTGGGTCGTG TGCTATTGCA CAGCGAGGGT GACTTCGTCT TTTTAAAAGC AAATGTGCAC 840
CCCAGCCAGT CGAGCAGTCC ATGCCACTCA GCGTGGGTGC TACTTAGTAA GCAGGGATCA 900
GTGGAGACTA CAGGATGTTC GTGCATCGCT GGTTTAGGTA GGTCCTGTAG CCACGCAGCC 960
TCTATATTAT GGAAGGTAAG TAAATAATAC TCATTGTTAT TATTTATTAT GTATGGTAAT 1020
GTCACGTTTG TGTTGACATA AGTAAGCAAT TAATGTATAA TAGTATGTTA ACGTATTTGC 1080
GTCATAACAT ACAGCTGCTG ACTTGGTTAC CATCTGCAGA CTAAGTATCT GGTCAAATCT 1140
CTTAATTTGT GAGTT 1155