EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24342 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:15178822-15179988 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr3:15179569-15179580ATATTTACATT-6.32
Nkx3-2MA0122.3chr3:15179162-15179175ATAAACACTTAAC+6.08
POU6F2MA0793.1chr3:15179202-15179212ATAATGAGCT-6.02
ZNF384MA1125.1chr3:15179633-15179645TTTTTTTTTAAT-6.74
Enhancer Sequence
TTGTTGGGAT TGTTGTGGTG GAAATGACTG ATACTGTGCG ACAGCTATAT TTTGTATTAA 60
AAATATATTG ATATAGTCTC TTATAATATT TTACAATGTT ATTTTCATTG TTGGAGTTTA 120
AAACTCTGGC TGTGCGACAA GGTGAAAACA GTGATTTTGA CACCTAAAGG GAGGTTGAAT 180
AACATGAAAA AAATATGTAA TAGTATTTTT TAGAGTAGAT TTTATTGTTA GTTTGACAAA 240
GAAAGAGGAA TCTGAACAAA ATAATATTTT TGGATATATG ATCAAAGGAC ATAAAAGTGC 300
CCGTAGTTGA AGAATTAACG TTACCCATGT TCCTTCATTG ATAAACACTT AACAAATAGT 360
TTTGCTTGTT TAAACTACTT ATAATGAGCT GAATCATAAG TTGATTGAAC ATAAAACAAT 420
TGAGTTAACT TAAACGATTT GTGTTGGAAA ACGTGAAGAA ATTGTGTGGC AGAACCCCGC 480
ATATTTTAGC GTAGCCTATT TGTGCTAACT AATTTATGCT AATCACCGTT TTGGTGCCTT 540
AAATTCCCTT TTCTCTCACA AGTCATCGAA TTTTGTTTTC ATGACCTAAG TAAATCTGTC 600
AAGAAAAAAA CGTTGTATAT TACCATGTTT CTTAAACAAA AAAGGTAATT TGTTAAACCA 660
CACATTATTC AATTTTGCCG CCACAACAGC TTACCTTTAC ATGATTATCA TCCGTGATCG 720
CTGCCCCATT AGTTACCTGT CAAAGTGATA TTTACATTAA TGACAAAAAC AAAAATGTTA 780
ATTTAATAAT TGTTAGTACA ATATTTAAAA CTTTTTTTTT AATAGTGACA TTACAATGAG 840
CAATACATTT AGCTAGGCTA ATTGTGCTAT CCCGAGTGTT GAGCAAGGCG TGCGGTTGAG 900
TCTCCGGGCC TGCAGCTTCA TATATCCATA TATTGGTAGT GTTTGATAAA ATAAAATAAT 960
ACACCAATAA CAAAATGTAA GGTCGTCAGC ATGAAAACAG CCTCATGAGG ACGCTGTCGT 1020
CAAACATACT TGTTTTCAAC AACATGCTGA CTACAACACA CTTGCCAAGA ATTTTCTTCA 1080
TTCTTATCTA AAGATCTCAA CTGGTTAAAG GGTTTATAAC TAGAAAAGTG AGTATCATTT 1140
ATATAGCACA TTGTGTTTCA TAATAA 1166