EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24326 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:14271673-14272660 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ELF3MA0640.1chr3:14272098-14272111AACACGGAAGTAA+6.44
Foxq1MA0040.1chr3:14272573-14272584TATTGTTTATA+6.32
KLF13MA0657.1chr3:14271838-14271856ATGCCACGCCCCTTATTG+8.62
KLF14MA0740.1chr3:14271839-14271853TGCCACGCCCCTTA+6.3
NFYAMA0060.3chr3:14271813-14271824GGCCAATCAGA+6.02
PHOX2AMA0713.1chr3:14272647-14272658TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr3:14272647-14272658TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr3:14272647-14272658TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr3:14272647-14272658TAATTTAATTA+6.62
RFX4MA0799.1chr3:14271906-14271922AGTTACTATGGTTACT+6.09
SP4MA0685.1chr3:14271837-14271854GATGCCACGCCCCTTAT+6
Enhancer Sequence
TTAAAATCTC ACTTGTCCTC AAAATGCACT TTTACATGAT TTGTGTATCT AAGTGTGTAT 60
CCCCCCACCC CAAAAGTGTG TATAACACAG CGCCCTCTAG GAGAACTGCA ATGACGCAAT 120
GATACACACT TTTGGGATCT GGCCAATCAG AAAGATACAA GGAGGATGCC ACGCCCCTTA 180
TTGATCTGAC GAATCAGAGG CGAAGTGCGT AAAAATAAAG ATGGCCGGCA GCAAGTTACT 240
ATGGTTACTT CACAGAATAA TAGAGACAGT ATAAATAAAA TTGCACTTTA ATTAGTATTT 300
AAATGAAAAT GACCAAACTG CGTCAAGAAA GCCTTATATT TGGTGTCCTT AAGCACGGTA 360
CTTTATTCTA AGTTTAAATC GTACTGTTTC TGCGCAGATC GCGTTGTATC CCCGAGGGAA 420
CGGATAACAC GGAAGTAAGT TACAGTATGT AACTTAGTTT AGGCGGTACA GTTGCAGATC 480
CGAGGAATAC TATGGCATAA TAGCGCGAAA CGGCCCGCGA GAGCGACACG CAACAGAATC 540
AAATGTTTTC CTCGTTTGTG TGTTCTTTGA ACTGTCTGTC TGTCCTGCAC TGTCAGCGAC 600
CGCACCGCGC ACCTCCCCCG CCCGCAGCTA CGCTCCCTCC GGCTACAAAG AGCTCAGCTG 660
CCCGGGAACG AAAGGAGGAG AGGAGCTCCG AGTCCAACCG GGAGGAAATT AGGCGGAATA 720
TAATATATAA TTTGATGTAT ATCCGTGTAT AATAAATGGT ATCATCACTT GGAAATTTTT 780
TGTATACATG TTTAACTTTT TTTCCAGAGT TCTGTTTATC TAAATAACAT GTTAATAAGT 840
ATTTGTTTAA GTTAAGAAAG CTAAAATGCC AGGTTTAAAT CATTTATAAA GAATAAAGTG 900
TATTGTTTAT ATTTCCTTTG CACTGAGATT TATATATATT ATAAATAGTA TGAGTGAATA 960
AATTTCTTAT TGAGTAATTT AATTACA 987