EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24309 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:13770307-13771850 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NRF1MA0506.1chr3:13771386-13771397GCGCATGCGCG+6.02
NRF1MA0506.1chr3:13771385-13771396TGCGCATGCGC-6.32
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr3:13771786-13771797AGGCACTCAAG+6.14
RESTMA0138.2chr3:13771401-13771422TGAGCTGTCCGCGGTGCTGAC-8.73
Enhancer Sequence
GACATATATA TGGCAACTAT TTGGTCAGAA GAGCAGTTCA AAATGCTGTT TTGGAATCCT 60
TTTCAGCAAA CAATTCCAAA TAGAACTGTT TTAATGACAG TGACGAACAT TCTAAAGATC 120
TAAGAACCTC ATGTTTACAC TGTAAGAAAC GTACAGCAAG CTAACAGAAA ATATGCTTGA 180
TTTATTGGAC TAATTTATGT TTCAGACTTC CAATAAGCCA AAGTCCACCA CTTTTTACAG 240
GTTTTTCAAG ATACACTAAA GTTTCTGAGG CTATATATCT CTTACCTACT ACATCATTTG 300
CGAGGTCTTT GATTAGATGT CCCACTATGG CATAGGCGAC TGCAACAATG ACCAACGCCG 360
CCATTAACAG GTACAAAACC CCCTTCGGTA AGGGAATGAG GTCTCGGCTG ACCGGTCTGT 420
AGTCTTTAAA CATCGGGTCC TCGCTTGAAA AGGAGTACTG AAAAGCATGT CCAGTTCTTT 480
CCGTTAAGTT CACACTTGTT AGGTTGATAG TATTCATCGC CAGCCTTCTT TTTCGACAAG 540
TAATCCGTCG GAATAGCGAT TATGTTTTTG TTTTGCTATC ACAAAATCGT CGTCAACGAA 600
TGTTGCGTTG ATCTCTGATT AAAATCTCTT CGCTTTATGC AGATCTGGAA AAGAGAGATC 660
ATTCAAGCAG TTAAAAAGGA GGGATTTAAA ACAATCGTCT GTTAGTTCAT GTTAGTTAAC 720
ATGTTTAACA ACAAAAACTA ATTAGGCTAA CATAAAGTAC CTCGTACAAA ACATTTGTCA 780
GTTCAACATA TACTAATGCA TTATTAAAAT GCAAAACTAA ACCTTAAAAA AGACGAATAA 840
GTAGTGTAAT GCATGCATTG TTCATTGTTA GCTAATTACA CTAATACAGA CCATTAAGCC 900
ATCAAAAAGA GTTTATGATT TAATACAGTT TGTGTCTTAC CTTCATTGTC GGTCGAGGTT 960
GAATTTATTC TATTTTAACG CTCATTTACG CTTAAAGTTG CCTTCTTTCT TCGTGTGCTG 1020
GCATCTTTTT TTCTGAGGGC GAACAACACA GACTAAATAC TTAAGAGAGT ACTGGTGTTG 1080
CGCATGCGCG TCAGTGAGCT GTCCGCGGTG CTGACGGCTC TCACTGTTAT TATCACCCTG 1140
AGTGTGTTTC CGAGATCGCC CACTGCCTCC CTGTTTGGAT CAGTGGAATG GATAGAGGTA 1200
GATTTCTTTC AGCCCGCCTC CGAGAAGTTG ATAAAGCCGT CACGTCCCAT CCAAGTCCCT 1260
TTAATTCGAT TAATTAAGTC GGGGATTCCG CGAACATGGT GATCCCTCTG AAATGACCTG 1320
TTTTCTCATT GACACCTGCT AAGTCCAGTT TATCAGACTA ACCTTGACTT TGTTTGGGCT 1380
AAAATTATTC GCTGCTTTGC GTGACAACAG CTCAGTCTGC TATTCGTCTA ATTTCTGATA 1440
TTTTTATATT AATTTGCCAC TTCGTTCTGA AACAGAAAGA GGCACTCAAG AAAAAAAGAG 1500
CTTGGAAAGT TTTAATATAA TTTTTTTTCA AATTCCTCTT TGT 1543