EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24294 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:13361514-13362721 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF1AMA0046.2chr3:13361913-13361928CGTTAATTATTTATT-6.59
HNF1BMA0153.2chr3:13361914-13361927GTTAATTATTTAT+6
POU4F3MA0791.1chr3:13361911-13361927CTCGTTAATTATTTAT-6.17
SOX10MA0442.2chr3:13361684-13361695AAAACAAAGAA+6.62
Enhancer Sequence
GTCACCTCCC ATCCTGACCA GCTAAGACCA GGCTGGAAAT GGCTGGAAAC CAGCCTGGAA 60
ATGGCCAAAA CCCCTCTAAA ACCAGCCTGG TTGACCAGCT AAAACCAGCC AACCAGCCAA 120
CCAGCCTAGG CTGGTTTAAG CTGGATTTTT CAGCAGGGAT AGCATAAACA AAAACAAAGA 180
AGGTTAAAAA TGACTACTTA ATAAAGGCTT TAAATAATTC TGATAAACTA AATACACTCT 240
TTAACACATC CAACCCTCAC AAGAAATGAA CGAATGAAAT TATGTATTTA TAAATTCAGT 300
TATATACATT TGGAATGGTG TTATGAACAA ACTGATAAAT AAAATGATTA CATAATTTTT 360
TTGCGTAGAT GTCAAAAAAT ATGCATAGCA GTTTCTTCTC GTTAATTATT TATTTTATTC 420
CGCGAGGTCA GTACTTTGAG ACGCCGCCTA TATCCTAGTG TGGCCTCCGC TGATTGGTCA 480
CGAACACTCC GGACCCGGAA CTGAGGCATG TGGTCTGATT TTGAAAAGCT GTAAACTGTA 540
AAAGTGTGTA AACGCGAGCT GTCATGTCAT GTGCGTGTTT TTATGACAGG AGATGAAGAA 600
ACATGGATCA GATTCTCAGG GCTCTGTTAC TACTGCTGAT AGCGCGCTTG CCGGCTTCAT 660
TTCAATGCTC AGGTGCTGTC AGCGAAGATG GAGGATGGTG AGATACAGAC ACAGAAACAG 720
CTCACATTAA AAAAATACCA TAGTAGTTTA AATATTACAG TGTTTTAGAA ATGTATTGTA 780
TTGTATATAT TATAGTATGT ACAAAACTTT ATTAATGAAC GCTACTTTAT TGAAGTATTA 840
ACCATAGTGA GCTGATAAAC TGTAATAAAT ACTGTTATAA ATACTGTAGT ACGCTTTAGT 900
GTATAATTTA CTATATTACT ATATAATTAT ATAACAATGA CTTTATATAA CTTGTATTAC 960
AGTAGCTACT ATAGAATAAG AACAACAGAT TAATTCAAAT ACTTTACTAT AGTACGGTTC 1020
CATCTCAAAT CCTGGCAACG CATATTGATA TATTGATATA TATTGATTGA TTTGTTGTGA 1080
TCATTAATGT TTTGTCTTTC AGGGGACTGG ATTCCAGTCT GCAAGATGAA GGCGAATGCA 1140
ACATTGAGAT CAGAGATGCA AACTCCATAA CACACACAGA GTTTATAAAT GAGTAAGAAC 1200
ACACACG 1207