EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24289 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:13310202-13311556 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid5aMA0602.1chr3:13311153-13311167TTAATATTGCTATA+6.1
FOXF2MA0030.1chr3:13310403-13310417TCACGGTAAACAAT+6.14
PKNOX1MA0782.1chr3:13311188-13311200TGACAGATGTCA-6.52
PKNOX1MA0782.1chr3:13311188-13311200TGACAGATGTCA+6.74
PKNOX2MA0783.1chr3:13311188-13311200TGACAGATGTCA-6.52
PKNOX2MA0783.1chr3:13311188-13311200TGACAGATGTCA+6.62
TFAP4MA0691.1chr3:13310988-13310998ATCAGCTGTT-6.02
TGIF1MA0796.1chr3:13311188-13311200TGACAGATGTCA+6.62
TGIF1MA0796.1chr3:13311188-13311200TGACAGATGTCA-6.74
TGIF2MA0797.1chr3:13311188-13311200TGACAGATGTCA+6.62
TGIF2MA0797.1chr3:13311188-13311200TGACAGATGTCA-6.74
Enhancer Sequence
AAGTCGGTTT TATAGTCACA CATTCTGACT TTATCCTTAA TAATATCATT TTAGAAAAGT 60
GTTATTTCGA AATCCTAAAT AGGGGAAATC ATATTAGCAA CCAATGACTA TCAAAGTACA 120
ACATTGTTCA GTCAAATAAA CAGTGCTAAT GTTATTTTCA AGGCATACTT GCATGAGATT 180
TCAGACCGAA TAATCAAAGT ATCACGGTAA ACAATAGAGA AAGCGTATCA CAAGCTGTCA 240
CTTAGTGAAT GTGCGAATAA AACCAAATTT ACCTCAATTG GCAACGTAAT GTTTTTGGAA 300
ATTAACCTAT CTGCTACTTA AACGAGAGGA GTCTGGACCT GGTGCAGTGC AATCTGAGCT 360
GCATCAAATG CTTTTTAATG CACTCACCTA ACCCGACCCC TAACCCTACC CATCTCAGTG 420
ATGCGATCTC TGCTTGCATA ATAAAGGCTG CATCCAGACA CTATTACTAA ACGTTAAGGT 480
GTGTGTTTAC TATACACTAA AACTCCAAAC ATGATATATG ACAGAAAGCA GACATTTCAA 540
GCAGAACGTA AATAAATAGA TGGCAGTTAT CTAACGTTAA ATCTTAAAGG CTCTAATTAT 600
TTAAAAAATA TATATATATT TAACCGCAAC AGAAATGGAT AATATAAATG TATTTGCTTA 660
AAACATACCT TAGTTTAAAG AAACTTCCTG GAAATCAGAA ACAGCTCGAA TAGATAAACG 720
ATCCACATTT CTCATTCGTC GGGTTTTTGT CATGTATTGT TGATTATTTT GAAATGACGC 780
TGCACAATCA GCTGTTTATT AACGTTAAGT TATCTGTTTT CCTTCACGAA GATGTTGATT 840
TGAGATAAAA GCGAACATTT ATGAAATAAT AATAAAAAAG AAAACACACA ATGAAGCGGA 900
TGTTCGCTTA TTACCAGATA ATATAACTGA CTATTCACGT TAATATTCAC GTTAATATTG 960
CTATAATCTG TGTGACTTGC AGCAACTGAC AGATGTCAAC ACCGCACCGT ACTTCTCCGG 1020
CGCATATTAT TTACGTCATC GGTGTTTCCG CTTCGCGCGT CTTGTTTCAT GTAGCTGTCA 1080
TATATTTTAC AGTCTAATCA GGTCTTAAAA TGAATATGAA TAAATCTGTG TTATTTCCAA 1140
TTAAAACATG CAATTTGACA GAATTACATA GTATCCCTAT TAAACATACA GTTACGGGTT 1200
GTCATTCCTA AAGAAGAAAA TGAACGCAAT AAGCTTAATT TTCAACTCAT AATGAATAAA 1260
ACTAAGACTA GATTTAATAT CTGGCTTCAA AGAGATTCAT CCCTAAATTG TAGGGTTTTA 1320
CTGTCCAAAG CAAAAGGGAG ATCAAGATCT GTCT 1354