EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24283 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:13114374-13115710 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr3:13115390-13115401TTTTATTGCTT-6.32
FOXC2MA0846.1chr3:13114606-13114618ATTGTTTACATA-6.52
Foxd3MA0041.1chr3:13114563-13114575AAATAAACATAC-6.11
PHOX2AMA0713.1chr3:13115439-13115450TAATTAGATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr3:13115439-13115450TAATTAGATTA-6.14
Phox2bMA0681.1chr3:13115439-13115450TAATTAGATTA-6.32
Enhancer Sequence
CTTTAAATGT CACTAAGCTG TATAGAAGTG TCTTGAAAAA TATCCAGTCA AATATTTTTT 60
ACTGTCATCA TGGCAAAGAT TGGGGGATAG GGCTAATAAT TCTGTTTATA TGCATGGGTA 120
CTGCATGTAT GTGCATATAT ATTTTTTCCC ATTTAGTTTT TACCAGTTGT TCATAAAAAT 180
TATGTAAAAA AATAAACATA CATGATTCCT TAATCAATAA CTGCTATTTG ACATTGTTTA 240
CATACATTAA TGAGGGTCAA ATAAGCCTCT TTCTCTGCTC ATCTGTATTG TCGCTTATTT 300
ATGGGCGGTC TTTTTTCACG CCACGCAGTT TCTCAGTGGA CAGCATTTCT CTCTCTCTCT 360
CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTGTGGGCAG AATGTCTCAT GGAGGAGTTT TGGATGCGTC 420
TGTGAACATC CACAGGTAGT TGCACAGTCT GCTTTTAGCG CTATCACTTT TGCATGTAAT 480
TCCTCGCGAG CGCTTTTGGA CACGAGAGTC TTCTGCCTTC ATATCTGTTT TAATTGTTGC 540
ATGCGCGTTA TTGTAAACAC ATCGGCATAC GGCAGCGATG CGCGTTTATA AACCTTTGCG 600
AATGCATTTT ACGTAAGTTT CCGCTTTATT TATTTATTTT TCTTTGCTTG GGAAATCGCG 660
CATGGATTGT GTTGCAAGTT TGTGAATGTG AAGGCAACGG CGGAATACAA TGGCAAGCGA 720
TTTGAAGCCT CGCTTGTGCG TAATGAAGAA AGGAGAGAAC GGCTATGGGT TTCATCTGCA 780
CGGAGAGAAA GGAAAAACCG GACAGTACAT ACGGAAAGTG GAACGCGCGT CCCCGGCGGA 840
GGCGTCGGGA CTGCGCGCGG GTGACCGTGT GGTGGAGGTG AACGGCGAGA ACGTGGAGAG 900
AGAGACACAC CATCAGGTAC ATCAACACAC ACACACACAC ACACACCTGA GCTGCTGGTC 960
TCAAATATTC AGCACACATT ATACTGGATC CTAATGCAGG ATCGTATTAT TATGCATTTT 1020
ATTGCTTATA ACAACAACAT GTGTGTTAAA ACAAGTGCTT GAAGATAATT AGATTAGGAT 1080
GTATCTCCAT ATGGAAGCAG AAAGAGCTTT ATTGCCACTG CCAGGTAAGA TTTTACATAC 1140
AAGGAGTTTG CTTTTGTGAC AGAAGAGTGT ATCAAAATGG CAGTGACAGG ACAAAAACAC 1200
TGATAATAAA GGAATTAAAT AAGTAAATAG AGAAAACAAA TGCATATTAC ATTAGGCAAT 1260
AATGTGTGTA AAGCTATATT ATGTGCAAAT TGACATGTAA ACTGAGTATG TTGTTAAATA 1320
AATGTGTACA TATGTC 1336