EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24275 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:12772622-12773747 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr3:12773490-12773502TTTGTTTATTTA-6.18
FOXK2MA1103.1chr3:12772622-12772633ATGTAAACACG+6.02
NRF1MA0506.1chr3:12772906-12772917TGCGCATGCGC-6.32
SOX15MA1152.1chr3:12773420-12773430AAAACAATAG-6.02
Enhancer Sequence
ATGTAAACAC GTTTGGTTTA ATTAATTGCG TAATACATAA AACAGAGTCA ACATGCCTCA 60
TGTAAATCAA TGTAAAAAAT AAGATATGTG CACACATATT CAATTAGCTT TTACAAATAA 120
GACAACTTTA AAACATTCAA GATGTGTGTC CTTTAAAACA GTGGTCCCCA ACCTTTTTAT 180
CACCGCGGAC CGGTCAACGG TTGTCAATTT TACAACAGAC TGGTGTGGGC CGGTCTTCAA 240
GTGAACACAG GTACTGCGCT CGTGCATCCA GGTTAACAAC TCAGTGCGCA TGCGCTAGTT 300
GCACTATCGC GGTCTGATTA TGTTTCAATC AAGGTTTATA TGCATCAAAT ACATCACATC 360
TGTGCCAAAC ATTTCAACTG GCGAACATAT TAACAATAAT ACAACCGTAT AGCCGAATTA 420
AATGTATGCA TTGGCATGTT ACAGCCCTAA TGAGCATGTA TATGTGAAAC TCCATACAGA 480
TACATATTGC AATGATTTCG GGTACTTACT TAGCGATGCA AGCACACATA TATGCACAGT 540
CCTTAAATGC TCTGCTGATT TGCACTCTAT AATACCCGTT TTATAACTTT AAACTATCTA 600
CAACCACCAC TGAGCGATAT TCTAGTGATC GTTCCCGCTC GGTGGTGGAT TTTGGAATAG 660
TCCATTTCAC GTGAGATGGC GGGGGTAAGT GGAAGAAACC AAGTTGCGGG GGGAATATTT 720
TCTACACAAA TAATTTATGA TTTCTTATGT AGCCTAAATG TTCCGCAGAC CGGTGCGGTG 780
GTTGGGGACC ACTGCTTTAA AACAATAGTG AAAAGGATGT GAGATTTCTG ATAAAAATAT 840
GATAAAATAC AGTCGTTATT TGTTTTGATT TGTTTATTTA TTACAAAAGC TTCATACCTA 900
AGTGTTTATG TGAATGTTCT TTGTATGTTC AGCTTTAACT GTTATTTTGG AGGAAATCAT 960
GAATCTTCTG ACCTTGTGTG ATGGCCAACC TGTTGATGTC GTATTTTCCA ACCAAACAAC 1020
CAATATACCA CAACAACAGA AAACACGGCA CATGACATAC TTCCTGCTTG ATTCTACATT 1080
AGCATTATAA ATATATATAT ATTTTAACAA AAATAAAGCA TCTTT 1125