EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24264 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:12231549-12231900 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr3:12231579-12231592AAATTAATTAATG+6.54
POU6F1MA0628.1chr3:12231581-12231591ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:12231581-12231591ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
GACCTCAGAT TAATAAAGGG ACTAAGCCGA AAATTAATTA ATGATTTTAA TCGAAATTAA 60
CCTAGTTACT TCAACTGTCA TAATTTTAAA CTAACACCGG CAGTTTAACA CCATGATTTA 120
CTGAACGATG CTTCACCACA GCTCTAACAT CATATACAAG CGATGTTCAC AAAAACACAG 180
ACCTGATCCT TTTATGTCTT GTTTTGTGAA GCTTGACAGC CCTTTTTCCA AATACAACCC 240
CATAAATCTA CAACATGACA GATCCTCCAT TATTTTTGCC AGACTTGTTC CCATGCAGGG 300
TCAGCAGTAA ACACCATGCC GCTTTATAAA GGAATCAGTC TTCACCTTTA A 351