EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24259 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:12010444-12011148 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LHX2MA0700.1chr3:12010926-12010936ACTAATTAAC+6.02
RFX2MA0600.2chr3:12010812-12010828TGTTGCCAAGGTAACA+6.05
RFX2MA0600.2chr3:12010812-12010828TGTTGCCAAGGTAACA-6.09
RFX3MA0798.1chr3:12010812-12010828TGTTGCCAAGGTAACA-6.31
RFX3MA0798.1chr3:12010812-12010828TGTTGCCAAGGTAACA+6.3
RFX5MA0510.2chr3:12010812-12010828TGTTGCCAAGGTAACA+6.56
RFX5MA0510.2chr3:12010812-12010828TGTTGCCAAGGTAACA-6.75
Enhancer Sequence
AAAAGATGAC AGGATTATTA CAGTTAAATA AAACTAAAAT TGAAGTCTTA AGTCTGAGTT 60
GGGGACAAAA CTCCACGAGG TAACTTACGT TAAGTTAATC AAAAGTGACT AACAAGAAGA 120
TAACACATGA TGTTCGTATC AAATATTACT TACCAACCTT CTCTGAAGTT TTTACTTCTT 180
TCACAACGAT ATGTTCTGTG TCTGGAAGGA ACGTTGGAAG AAATGAATGA AAACACGTTA 240
CAGGCGAAGA TTTCTTTCAT GTCGACACGA ATCAAAACGG TTAACCTGGT AAAATGTTTG 300
GAGATGTTTA CGTGTGCTAA CGTTAGCTGC TAAATTAGCA GAATCCAAAA AGCACGCCAA 360
TAAGCAAATG TTGCCAAGGT AACAAGTGTC ATTCAGATTA TAAGATGTTT CGTTTTTTAA 420
TAAATAAATA ATAATTGTAA CTTACAATTT TCTTAGATTA CTTTTAGTTT ATAAATGCTA 480
TAACTAATTA ACAGAGTATA AAAAGGGGTA GCCTAAACAG ACAAAAATAA ATAAATAAAT 540
CAGTTTGTGG GCTTTGATAA CTAATTTAGA CCAGCGTTGT CCAAACTTTT TCTTATAAAG 600
CGCCAAAAAA AGCAAACTTG ATTGAGGGCT GTGGGCCGAA GTTACACTGT ATTACATTTG 660
ACATGGTTAA TTTCCTAATT TATTTGCGTA TTATTTTTAA AAGA 704