EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24140 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:7667353-7668400 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr3:7667372-7667384AAACAAACATAC-6.37
Foxj3MA0851.1chr3:7667365-7667382AAAAGATAAACAAACAT+6.69
POU3F1MA0786.1chr3:7668368-7668380TTATGTTAATTA+6.04
POU3F2MA0787.1chr3:7668368-7668380TTATGTTAATTA+6.07
Enhancer Sequence
AGGAATGCAA CAAAAAGATA AACAAACATA CATGAGGTCA AATATAACAA ACTTGAATAA 60
CACAAACAAG ATCTAAGAGA CATATGAGCA GGATAGTGGT GGATCAGATT AAGTGGTCAG 120
TTTGGTAGAT CAGATGCGAA GCATTCATAA AATAAGTGAG TCTTAAGTAA GGATTTGAAT 180
TCAGAGATAT TATTAGCAGA GCGGAGTGAG TGTGGTAGAG AGTTCACGAG TTTGGGTGCA 240
ATAACACTAA ATGATCTGCC CCCCATTGAA GAGAGGCGAT ACCGAGGGAC AGCAAGAAGG 300
CCAGAGTCAG CAGACCGTAA AGAGCGAGTT GGGGTGTAGG GGACAAGCAT GTTGCAGAGA 360
TAGGAGGGTG CAAGGTTATT TAAGGATCTA AATGCAAGGA GAAGAATTTT GAATTTAATC 420
CGGTATGCAA CCGGGAGCCG ATGAAGATCA TACAAGATTG GGGTTATGTG AGCCGAACGT 480
TTGGTATGAG TGAGTATTCT AGCTGCAGAG TTTTGAATAT ACTGTATTCT GGAGATGAGG 540
CTGGCAGGCA GGCCAATGAA AAGAGCATTA CAGTAGTCGA TGCGTGAGGA GACAAATGCA 600
TGGATAACAG TCTCAGCATC CTTGCTACTG ATTAAGGGAC GCAGTTGTGA AATGCGACGT 660
ATGTGAAAGA ATGCAGATTT AGTGACAGAT TTAATGTGTG ACTGAAAAGA CAGTGTGGAG 720
TCAAAGATTA CACCTAAATT TTTTACAGAA GTAGATGTTT TAATGTGCAA GCCAGCAATC 780
TCACAGGAAT AACTGGTGGG AATATTGCTG GTAAGTGCTG GGGTGCCAAT AAAAATTATC 840
TCAGTTTTGT CCATATTAAG TTGATCACTT TTATAAACAG TAACATCAGA TACCTGTCCT 900
GATCTCAGGT GTTTCATGTA TGATCACTTT TATATACAGT AACATCAGAT ACCTGTCCTG 960
ATCCCAGGTG TTTTGTGTGT GATGACTTTA AATAATAATA GAAAATAAAT ATAAGTTATG 1020
TTAATTAACT AAGATCGAGA AAGAAAA 1047