EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24110 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:7342640-7343698 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EHFMA0598.2chr3:7342707-7342719TACTTCCGGTTT-6.02
ELF1MA0473.2chr3:7342707-7342719TACTTCCGGTTT-6.07
ELF2MA1483.1chr3:7342707-7342719TACTTCCGGTTT-6.32
ELF4MA0641.1chr3:7342707-7342719TACTTCCGGTTT-6.11
ELK3MA0759.1chr3:7342707-7342717TACTTCCGGT-6.02
ETV1MA0761.1chr3:7342707-7342717TACTTCCGGT-6.02
ETV2MA0762.1chr3:7342707-7342718TACTTCCGGTT-6.14
ETV4MA0764.1chr3:7342707-7342717TACTTCCGGT-6.02
GBX2MA0890.1chr3:7342858-7342868ACCAATTAGC+6.02
IRF1MA0050.2chr3:7342989-7343010TTTCGTTTTCATTTTCTCTCT+6.16
IRF1MA0050.2chr3:7342983-7343004GTTAAGTTTCGTTTTCATTTT+7.08
IRF3MA1418.1chr3:7342986-7343007AAGTTTCGTTTTCATTTTCTC-6.98
IRF9MA0653.1chr3:7342987-7343002AGTTTCGTTTTCATT-6.41
STAT1MA0137.3chr3:7343391-7343402TTTCCGGGAAA+6.32
Stat4MA0518.1chr3:7343391-7343405TTTCCGGGAAATGC+6.25
Enhancer Sequence
ACACCTATAT TTCACTAAAA AGTGTAAATT GGTTGTTTTT GCGTTATTTC AAGTTATTTC 60
AAATTTGTAC TTCCGGTTTG AAACGAATTT TTGAAGCTGC GTCACGGTCA CGACATAATA 120
GCGTGTATTC CAGCGTGCAG ACTGGACGTC TGTGCCAGAG TGTGTCTTAT TACGTCTTAC 180
AGTGTGATGC ATTAATGCAT GAGTAAGGCT TGGTTCAAAC CAATTAGCGC GCTCTATTGT 240
GCAACTTCAT TAATATTCAT TAGTGTCATA GTGTTTAGAC GACAGAGACG CCACGTTGTG 300
TTGGCAAAAC AAGCGTGAAG TGTTGCTTTT ATAGTTTGCT GCAGTTAAGT TTCGTTTTCA 360
TTTTCTCTCT GTGAGAGCTC AGACTCATGT GTGGATTAAC AGTGTACGCG ACGCTCGACA 420
ACAATAACTT ACGTGTCTAA GGAGGATTAT TGTTTACCTG AGAGCTGTTC TCATCTGCAA 480
ACGCTGAGAT CCGGATTCAC TTGTAGTCTT CTCTTAATAA AGACGCGGCT CTAGTTGCTG 540
GTGATTGTCC TGTCTCTACA GATTTGGTAA GTGAGCGACC AGCGCTCTTT GTTTATTCAG 600
TTTGTTCGTA TCGAACTAAG TTAACCATTG CACCAAGTGT AAACATGTTA GCACCACAAC 660
CAAACTTTAA CCTCGTGTAG GATTTTCGCC GCATTTTGTG ACCGGAATAA CACACGCGGC 720
TTTCTGAATC TACCTGCCGA GTGCATGTAA GTTTCCGGGA AATGCTGTTT TTTTTCTCTC 780
ATTCGCCGTG CGGTATCAAA CATTGCATGA AAAATACACG CTTAGAGCAG TTCCTCGAAT 840
CAAATATCTC GTTTGTCGCG AGGGGCATGA ATGAATTCCT TGAATGAAAG AGCCAAACTG 900
CAGTTAAAGT CCAACATTTA ATAATTTGGC AAATAATTCG ACTACAGATG TCCATGTAGG 960
TTAAACACCA TCACTTTCTC CTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 1020
GTGTGTGTGT GTATATTTTG ACTCTGAAAC TCGCGCGT 1058