EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24101 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:7219850-7220756 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EGR1MA0162.3chr3:7220359-7220373AGCGCGTGGGCGGG-6.03
EGR3MA0732.1chr3:7220359-7220374AGCGCGTGGGCGGGA-6.19
EGR4MA0733.1chr3:7220358-7220374TAGCGCGTGGGCGGGA-6.21
FOXC2MA0846.1chr3:7219899-7219911ATTGTTTACATT-6.32
Foxj3MA0851.1chr3:7219896-7219913CTGATTGTTTACATTTA-6.19
Lhx3MA0135.1chr3:7220301-7220314AAATTAATTAATC+7.82
Nkx3-2MA0122.3chr3:7219932-7219945ATTAAGTGTTTTA-6.16
POU6F1MA0628.1chr3:7220303-7220313ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:7220303-7220313ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
TTGAGTGACC GATTCTACAT GTCATGTGTG CAGCGTGATC ATGTCTCTGA TTGTTTACAT 60
TTATCTCTCA ATATTTTAAT GAATTAAGTG TTTTATATTA TTATACTAAT CCCAAATTCT 120
GTTTTACTGC AAAATAAAGC GTTTGCGTCT CTTCAAGAGT TTACACAAGC ATATGTTCAG 180
TTAAACAGTC AATATTCAAT ATAATCAGCA TTAAACTACC TCTTAGTGAA TGAATTAGAT 240
GGAGACACAA ATGAAAGGTG TCCAGATAAC CCGTGAGTAA GACATTACAA GAGTGTTTAC 300
AGCGTAGCAT CGAGCTAAAA ACAAGAGAGT ATATTAGCAT TGAGCACACA TGTTAAAGCG 360
GTTCACACCG CAAGTCTGCG AACGCTACTA TGGTCAGATA TCATACACTT ACTCTGAACA 420
GACGAATAAC ACCTATAACA GAAGAGGAAT TAAATTAATT AATCCTCAAA CAGCAAAATT 480
CAGCTCTCTC TGATCTCCGC CTCGGAATTA GCGCGTGGGC GGGATATTTG CCTGCACGCT 540
GACCAGCGAA ACCTGATTGG CTGCAGTCAG GAGAAATAGT GAGTGGTTTG TTTTGGGAGT 600
GCACCTATTA TGAAGTGTTT TGGGTTGACT TTATAATTTT CCTAAAAATG TTTAAAATAC 660
GTTAAGCGTT TTAGAATGTA TTAACTTAAT TTAGCTTAGC ATTAGCTTAA TTGTTTTAAC 720
TTGCTTTCAT GCAATGGAGT CAGGGCTAAC GTTATATTTC AGTCAGCATA GCGTGAAATT 780
TGCATCTTAA CACCTTATCT TGGTTTTGTG TGATACACTC AGAAAATATG AACTTATGAA 840
GAAAGTAAGA AACAGAATTA AAAAAAATAC GCCTTCGATT TTTTTTTCTA TTTTAAATGT 900
TTCCAA 906