EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24089 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:7114316-7115456 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr3:7114894-7114913TACTGCCATCTAGAGGACA-6.43
Nkx3-2MA0122.3chr3:7115338-7115351TAAAACACTTAAT+6.16
Enhancer Sequence
TACAGAAGAA GAGTCCAGTG GAGGAGCTCC AGACTTCTGT TCTGTGTTTA CTTTATTATT 60
AAAGTTTTTG CTTCTAAATG GGCGAGTTTG AACTACGAGT ACAATAGAAT AAATCTTTAG 120
TAACTTAATA TAGCTTAGCT TAATTTTTTA CTTGCTTATA AAGGACTCAG TGTTATAATT 180
CAGTCAGGAA AGCATGAAAT TTGCATCTTA CTGCCTTAAT CTTGCTTTTG TGCGATACCC 240
TCTAAAAATA TGAACTGTTA AAGAAGAAAA GTAACATAAT TAAGGACAGA ATCATAAATA 300
AGGAGAGAAT CATACCTGTT TGTGTATGAA ATATCAGCTG AAATAAAGTG CAGCGTTCCT 360
GATCGCTTCT GTAGAGGAAT TTACAGTTGA GCCCCAATAT ATACTGAATA AAGGCAAGCA 420
GCTGAAGTGT CCGTCAGATA AACAGTCTGG CAGCAGAAGG TTCAATATAA AAGCTGGAGT 480
GTGTTGTCGT GATTTCTTCA GCACTGAACC TCCACACGAG TTTTCCTTGC TCTGAGCTTT 540
TACTCGGATA ATGCCTCTGC TAACTGTGTG CTCAGCACTA CTGCCATCTA GAGGACAATA 600
ACAGCAGCAT CCACTAATCG CCACATGCGG AGATCGGAGA GAGCAGAGGT TTATTTCCTC 660
TTCTGTTGCG GGTGTTGTTC GTCTGTTCAG AGTAAGTGTA TGATATCTGA CCATAGTAGC 720
GTTCGCAGAC TGGCGGGAAT TATCTTGCGG TTTGAACCGC TTTAACATAT GTGCTCAATG 780
CTAATATACT CTCTTGTTTT TAGCTCGATG CTACGCTGTA AACACTCTTG TAATGTCTTA 840
CTCACGGGTT ATCTGGACAC CTTTCATTTG TGTCTCCATC TAATTCATTC ACTAAGAGGT 900
AGTTTAATGC TGATTATATT GAATATTGAC TGTTTAACTG AACATATGCT TGTGTAAACT 960
CTTGAAGAGA CGCAAACGCT TTATTTTGCA GTAAAACAGA ATTTGGGATT AGTATAATAA 1020
TATAAAACAC TTAATTCATT AAAATATTGA GAGATAAATG TAAGCAATCA GAGACATGAT 1080
CACGCTGCAC ACATGACATG TAGAATCGGC CACTCAAGAC TTACACACAC ATTTATTGAA 1140