EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24087 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:7088303-7090199 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CLOCKMA0819.1chr3:7089359-7089369AACACGTGTT+6.02
CLOCKMA0819.1chr3:7089359-7089369AACACGTGTT-6.02
CTCFMA0139.1chr3:7088986-7089005TACTGCCATCTAGAGGACA-6.43
SOX10MA0442.2chr3:7088316-7088327TTCTTTGTTTT-6.62
ZNF384MA1125.1chr3:7088422-7088434AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:7088423-7088435AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:7089946-7089958AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:7089947-7089959AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:7089948-7089960AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:7088420-7088432ATAAAAAAAAAA+6.27
ZNF384MA1125.1chr3:7088421-7088433TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr3:7089945-7089957TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr3:7089944-7089956TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr3:7088419-7088431AATAAAAAAAAA+6.62
ZNF384MA1125.1chr3:7089943-7089955ATTAAAAAAAAA+6.74
Enhancer Sequence
TTCTTTTTTT CTCTTCTTTG TTTTTTTCAC TTATTTCATT CTTGTTAAGA AATGTAAAGT 60
GATTGTATTG TATAACAAAA CAACTGTAAC TGTACATGCT GGTTCTTGTT AATAATAATA 120
AAAAAAAAAA AACTTCTGTG TTTACTTTAT TATTAAAGTT TTTGCTTCTA AATGGGCGAG 180
TTTGAACTAC GAGTACAGTA ATAAAGACAA AGAATAAATC TTTAGTAACT TAATATAGTT 240
TAGCTTCATT TTTTACTTGC TTATAAAGGA GTCAGGGTTA TAATTCAGTC AGGAGAGCGT 300
GAAATTTGCA TCTTACTCCC TTTATCTTGC TTTTGTGCGA TACCCTCTAA AAATATGAAC 360
TGTTAAAGAA GAAAAGTAAC ATAATTAAGG ACAGAATCAT AAATAAGCAC AGAATCATAC 420
CTGTTTGTGT ATGAAATAGC AGCTGAAATA AAGTGCAGTG TTCCTGATCG CTTCTGTCGA 480
GGAATTTACA GTTGAGCCCC AATATATACT GAATAAAGGC AAGCAGCTGA AGTGTCCGTC 540
AGATAAACAG TCTGGCAGCA GAAGGTTCAA TATAAAAGCT GGAGTGTGTT GTCGTGATTT 600
CTTCAGCACT GAACCTCCAC ACGAGTTTTC CTTGCTCTGA GCTTTTACTC GGATAATGCC 660
TCTGCTAACT GTGTGCTCAG CACTACTGCC ATCTAGAGGA CAATAACAGC AGCATCCACT 720
AATCGCCACA TCCCCTTTCA TTAGAGAGAA ATCATCATCT GCAGAGCACA AACAACCGAT 780
ATACAACATA AAACTCTCTA ATTGTGACTA AAAGACAAAG TCACCTTCAC ACATTTTAAA 840
TATAAGTGCC CACATAAAAA ATTGTAATAA ATACTATATA GTGTTTTACT GTAGTAAAGT 900
ACATGAATGA ATCTGTTACT GATAAAAGCA GCGCTTAATT TGAGCCGGAT CCTGTGCCGC 960
AATCTTTCCC AGCCGTGCTT GCTTTGTTTA TGGGCGATTG TAAGTTCTCG CTGGTGACGC 1020
CATCATGTGG TTTGTATTTG AATGGCGGAA GGCGGGAACA CGTGTTCGAA AATAGAATCA 1080
GTGTTCCAAA CCGCAGAATG TTGATAAGAG GATGTCAAAG GTTCTGGTGA ATTTCCGGCT 1140
ATTTCCGCAA GATTTGTGAA GTACTTTAAC CGTTGTAAAT ATTGACCACA ATACTATTAT 1200
GTGTTGGAGG CGAATCGATC AGAACTACAT AATCTGAAGT GTAAACAAAC TACAAACATG 1260
GCGGACGAGC GGGCCCAACC GTCAAAAAGT AGAGGCTTCG GTAACATTGT GTGAATGACT 1320
ATTAATTAAC ATTTAGCCGA GTGGAAAATA TTTAAATTGT GTTTTCCGCG TTATATTTCC 1380
TCTGCAACAA TAATGTCAAC TAATATAAAG ACTTGTTTGG ACATTACCTT CTGAATGTTA 1440
TCCAAATACC TGAAGAGATT TCTCAGCATG AAAGACTGGT GAATGGCAGA TTAACCTGCT 1500
GTTGCTTCTC CAATATGGTA GGCAACTAAA TATGTAAGAA ATGTGGATGA TGTGTCGAGA 1560
TGACAAGAAT TTAGTATAAG AATAAGGACA CAGTTAATGA GTTCAGAATG GAGAAGATTG 1620
GACTCATTTT AAATGTAAAA ATTAAAAAAA AAAAAAAGTA GACTGGCACT TTAATTTCTC 1680
TTCTTTTCCC CCTGTATTTC TTTGATTTCT TCTCTTTACT GAGGTGTTCC TATCTTGTTT 1740
TGTAGATCTG TATCACAATG AGAGATTATC TTTGCTTTTC TGCAGTTGAC ATCATGTGTC 1800
ATGAGTAAAC AACCTAAATG TGGACATGCA ACAAAGAAAA CACTTTAAAC GTTAATATAT 1860
TTTACTGATA TGATGTAATA AAGCAGCAGA AATCAT 1896