EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24086 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:7072139-7075000 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr3:7073846-7073865TACTGCCATCTAGAGGACA-6.43
FOXA1MA0148.4chr3:7074272-7074288CTTTGTTTACTTTACT-6.25
FOXA1MA0148.4chr3:7073333-7073349TTTTGTTTACTTTATG-6.94
FOXC2MA0846.1chr3:7073334-7073346TTTGTTTACTTT-6.62
FOXC2MA0846.1chr3:7074273-7074285TTTGTTTACTTT-6.62
FOXD2MA0847.2chr3:7073335-7073348TTGTTTACTTTAT-6.3
FOXD2MA0847.2chr3:7074274-7074287TTGTTTACTTTAC-6.87
FOXP2MA0593.1chr3:7073334-7073345TTTGTTTACTT-6.62
FOXP2MA0593.1chr3:7074273-7074284TTTGTTTACTT-6.62
Foxj3MA0851.1chr3:7074697-7074714AAAGTGTAAACAAACTA+6.05
Foxj3MA0851.1chr3:7073331-7073348TCTTTTGTTTACTTTAT-6.87
Foxj3MA0851.1chr3:7074270-7074287TGCTTTGTTTACTTTAC-6.91
Foxj3MA0851.1chr3:7072586-7072603AGAAAATAAACAAACAA+6.9
ZNF384MA1125.1chr3:7074288-7074300TTTTTTTTTTAT-6.27
ZNF384MA1125.1chr3:7074287-7074299TTTTTTTTTTTA-6.37
ZNF384MA1125.1chr3:7074289-7074301TTTTTTTTTATT-6.62
Enhancer Sequence
TTAGATATTT TTTTGAAAAC AGGTCAAAAC TACTAAGTAA GTTATTATTA TCATTACATT 60
ACAGCTCAGG GATGTTCAAG GACAACATGT TTGTGCACTT TCTAAAGATT TTAGCTCTGT 120
TTTTAAATAA AGGGTTGGAA ATTAATGATT TAAAAAAAAT CTGTTTCATT AAATAATCAA 180
AAAATAATCC ACAGATTAAT CAATTATTAA AATAATCATT AGTTGCAGCC CTAAAAAGTA 240
CATTTAAGTG TGCAACAGAA GAGTACGCAA ACTTTGGCAC ATACTCCTTC CTCATTAACT 300
GAACGTTATG TTGTTTAGTC ACGTCCACTG TAGCGTCCTG GTTAAAAGAT GACTAAGTCT 360
TCCACTGATG TTCACGATTC ATTTATTGGT CACACTTCAT AGAATTTGTT CGCATTATTC 420
AATCATGAAT CACCGTAAGA ACTAGAGAGA AAATAAACAA ACAACAAACA CAAATAAATC 480
CCGAAAATTA ACACTAAGCC AACATCAACA ATTAAACAGT AAACAAATAA ACCAAATTAC 540
CTTATTTTTC CCTCTAAACA GGAGCTATAA CTCATGAAGG AGGAATCCGT GAAGCAACCG 600
TATACCTGTG CCCCTTTTAC CGTGTTTCAC CTAGCGTTCC GTATATTGTT TTCATTCATT 660
TCTACACGCA ATTTATACAT CCGGTAAGCT CCGCAATTTT GACGTCATAA TTAAAGTCCC 720
CAAACAACGT AATTCATTCA ACAAATCAAC CCGTATAAAA AAAACAACGA AACATCAAAA 780
ATAAATAAAT AAATAAATTC AAAATCATAA ACAAAGTAAC ACATATTTCA AGTTTCTTTA 840
CATCCACTTT CAATCATCTC CACACACCAT TCACATTTCT TTCATATTTA ATTCCCTACA 900
TTATTGGAGA TTCAGCTGTG TGTTAATCTG CTATTCTCAA GTCTTTCATG CAGAGAATCT 960
CCTCAGGTCT TTGGATAATA ATAATTCGTG TAACGGTAGT AATGGAGCAA GTCAATGCTG 1020
GAAAATAGTA AAATACAAAA AGAAAAGAAG AAAACAAACA GTCCAGCTTA CAGAACTAAA 1080
ATGCCCATCA GTGCTTCACA CCCCAGTCCA GCAGGTGACA GTAGAGCATC TTTAATGCTG 1140
ATTCACCACA AAACATCTAC AGAAGAAGAG TCCAGTGGAG GAGCTCCAGA CTTCTTTTGT 1200
TTACTTTATG ATTAATGTTT TTGCAGTTCC CGGGTCTAAA TGGGCGAGAT TGAGCCACGA 1260
GTCCAGTAAT AAACTCAAAG AATAAACCTT AGTAACTCAA TATAGTTTAG CTTAATTTTT 1320
ACGTATAGGA CTCAGGGTTA AAATTCAGTC AGGATAGCGT GAAATTTGCA TCTTAATCCT 1380
TTTATCTTGC TTTTGCACGA TACCCTCTGA AAATATGAAC TGATAAATAA GGAGAGAATC 1440
ATACCTGTTT GTGTATGAAA TATCAGCTGA AATAAAGTCC AGCGTTCCTG ATCGCTTCTG 1500
TAGAGAAATT TACAGTTGAG CCCCAATATA TACTGAATAA AGGCAAGCAG CTGAAGTGTC 1560
CGTCAGATAA ACAGTCTGGC AGCAGAAGGT TCAATATAAA AGCTGGAGTG TGTTGTCGTG 1620
ATTTCTTCAG CACTGAACCT CCACACGAGT TTTCCTTGCT CTGAGCTTTT ACTCGGATAA 1680
TGCCTCTGCT AACTGTGTGC TCAGCACTAC TGCCATCTAG AGGACAATAA CAGCAGCATC 1740
CACTAATCGC CACATCCCCT TTCATTAGAG AGAAAACATC ATCTGCAGAG CACAAACAAC 1800
CGATATACAA CATAAAACTC TCTAATTGTG ACTAAAAGAC AAAGTCGCCT TCACACATTT 1860
AAATATAAGT GCCCACATAA AAATAGAAAT AAATACTATA TAGTGTATTA CTGTAGTAAA 1920
GTACATGAAT GAATCTGTTA CTGATACAAG CAGCGCTTAA TTTGAGCTGG ATATTGTGTC 1980
TTTCCCAGCA GTACTTTGCT TTATTTATTC ATTTATTTAT TCATTTTTTT AAGAAACTGT 2040
ACAACTTAGT ACAACTAAGA ATACAACTTA GAACACAGTA AAAGTTCTTT TAGATACACA 2100
TAAAGAGCAA AACCAACATA AAATGCAGCT TTGCTTTGTT TACTTTACTT TTTTTTTTTA 2160
TTCCTAGGTT CTGCTGGCTG CGATCTCCGA ATTATCCTTG CCAATCTTAA GCCATCATAG 2220
GTTGTTTTGG TTTAATTTGG TATTTCCCCA GCCGTGCAGA GCCCGGGGGA CCAGCAGACT 2280
AGCTCCAGCT TGGCCTCCGC TGGTCCCTTT GCTTTGTTTA TGGGCGATTG TAAGTTCTCG 2340
CTGGTGACGC CATCATGTGG TTTGTATTTG AATGGCGGAA GGCGGGAACG CGTGTTCGAA 2400
ATGGAATCAG TGTTCCAAAC CGCAGAATGT TTATAAGAGG ATGTCAAAGG TTCTGGTGTA 2460
TTTCCGGCTA TTTCCGTCAG ACATATTAAG TGCTTTAACC GCTTATTTTT CCTATTATAT 2520
GTTGGAAGCG AATCAATCAG TACTACATAA TCGGGGGAAA AGTGTAAACA AACTACAAAC 2580
ATGGCGGACG CGCGAGGCCA ACCGTCAAAA AGTAGAGGCT TCGGTAACAT TGTTTGAATG 2640
ACTATTAATT AACATCTAGC CGACTGGAAA ATATTTAAAT CACGTTTTCC GTGTTATATT 2700
TCATCTGCAA CAACAATGTG AACTAATATA AAGGCGTGTT TGGACATTAC CTTCTGTATG 2760
TATAGTTATC AAAATACCTG AGATTTCTCA CCATGAAAGA CTCGTGAATG GCAGATTAAC 2820
TAATACAAAT AATTTTTACA GTAAAGTTTT AATAATACAA A 2861