EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24068 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:6911956-6913413 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Atoh1MA0461.2chr3:6912965-6912975AACATATGTT+6.02
Atoh1MA0461.2chr3:6912965-6912975AACATATGTT-6.02
IKZF1MA1508.1chr3:6913282-6913294GAAACAGGAAGG+6.52
Lhx3MA0135.1chr3:6912465-6912478AAATTAAATAATC+6.03
OLIG1MA0826.1chr3:6912965-6912975AACATATGTT+6.02
OLIG1MA0826.1chr3:6912965-6912975AACATATGTT-6.02
ZNF384MA1125.1chr3:6912910-6912922ACTAAAAAAAAA+6.32
Enhancer Sequence
AGAACTGATT TTATTTATGT TGGATAACGA ATCAAAAAAA TGTGTGGCGG ATGCCTGACA 60
AAATTTAGAA GAGTATAAAT CTTTATAAAA TCTGGCACAA AATTCTGCAA TTGTTTTGAG 120
GTCCTCAGAT ATATTCCCGT CAATACGTAG TTTTTGAATA GAATATTTAA CTCGCTGCCT 180
TTCTAGCCTA AAAAAATATG CAGAGTTCTG CTCACCCTCT TCTAGCCATT TTCGACGAGA 240
CCTTATGAAG GCACCTTCAG CTTTTTGTTT ATATATATCT TCTAAAAGAT GTTTCTGATC 300
TATAAATTCA GATCTCTCTG TGTCGGTAAG ATCCTCTATA TTTTTATGTG ATAATACAGA 360
TATTCTAGCC ATAATTTGAT CTTCATTTTT TTTTCGAGTT TTTGCTAATA GACTACAATA 420
ATTTCTACAG TATTTACCAA TTTCAAATTT AAGAAGTTCC CAATTGCTAC AAAATAAATT 480
TTCTCTATTA GCTTTATCCC AATAAGAAGA AATTAAATAA TCAATTTTAG TTTGAACTTC 540
ATTGTGTTTT AAAATTGAAT TATTAAGTTT CCAGTATGAG GATCTTTTAT GTGGGGGAGT 600
AGAGGATATT GGTACATAGA TAATAATGGC TTTATGATCA GAAAATAAAG AGGGAATAAT 660
ATCCGTTTTT ATGTTTGATA ATTCAGCTGA AGTTAACCAA TAGTCAAGAC GGGATTGATT 720
AGAAAGTGAG TTATTGTTCC AAGTGAAAAC TTTTTGTAAA GGATGAGTTT CTCGCCACAC 780
ATCAACAACA GAAAACTTTT GTACAAAAGA AAATAAATAA TCATTATTAA TACAGGTGGG 840
ATGGGGGGGC CATCTATCTA ATGTGTTATT AAACACAACA TTAAAGTCAC CACCAATAAT 900
TAAATAAGAG TTTGGATATT TAGTTAACAT TTTAGATAAT TGAGTTTCTA ATTTACTAAA 960
AAAAAAACTT ATTATCTTTT GGAGAATTAT AACCATAAAT ATTGGCAATA ACATATGTTA 1020
GGTTAGCAAA CTGTAAAGCT AGTAAAATGA AATGACCATT AATATCACAA TCACTAGCCA 1080
AAATGTTTCC ACTAAAATTA TTTTTTAAAA TACAAACTCC GGCAGAATGT TCATTTCCAT 1140
GGGACACCCA AATTTCTGAC CCCCATTGTG ATCTCCATAA ATTAACTTCT TGTACGGTTG 1200
AATGAGATTC TTGAAGAAAG CAAAAATCTG TTTTAAAACG TTTAAGAAAT AAAAAAACTG 1260
CTTTTCGCTT AAGAATGTTG CGTAGCCCTC TACAATTTAA AGAGACAATA GACAAGGACA 1320
TAAAAAGAAA CAGGAAGGAT AAGAAAAAAC ACTGGAAACA GGAACAAGAC CTAAAAATTA 1380
CTACAAAGTG AGAATATCAC TATAATGGAA AACCAAATGG TCAAACCCTA AATCGGAAGG 1440
GATGAGGACA ACAATCC 1457