EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24044 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:5900314-5900822 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr3:5900785-5900806ACTTACTTTTTGTTTCACTTA+6.08
LMX1BMA0703.2chr3:5900713-5900724TTAATTAAATT-6.32
PHOX2AMA0713.1chr3:5900714-5900725TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr3:5900714-5900725TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr3:5900714-5900725TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr3:5900714-5900725TAATTAAATTA-6.62
SOX10MA0442.2chr3:5900678-5900689TTCTTTGTTTT-6.62
Enhancer Sequence
TTCATTTGCG AGTGCTATTT TCTAGTTTTC TCCCTGTTTA TCTTGATTTA TCAGTTAATA 60
TTGTGCTGTT CTTGTTAATG TATAGTGAGA TTTTGAACGA TCTTTATGAG AATTGGATTA 120
CCTGAGATCT TGTTTTGCTA ATGGCTAACA GTGTGTACTT TACGAGAATT CTAGCATTTC 180
GAGCAGCTTA GTATTATTGT GTATTAGTTC GTTTTTGGAG GCGTTGCCAC ATGTGTACTT 240
ATGTTTGGGA GTTAAGAAGT TTAGTTAAGC TACGTGCTGA AGATTACGGT TTTGTTTCTG 300
CATTTTTCTT TGTTCAGCCA GTTTAGTGGG TTGGGGTTTA GTTAGTTCGT TTTGTTATAT 360
TTATTTCTTT GTTTTGGCAA CACTCCTATT TTTCTTTATT TAATTAAATT ATTTAAAATT 420
ACATTTATCT TCCATCTTAC ATTCATTGTT TGACATTATC CATTAATAAA TACTTACTTT 480
TTGTTTCACT TATCAAGCGT ATGCGTCT 508