EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24021 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:5124581-5126946 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ASCL1MA1100.2chr3:5126374-5126384GGCAGCTGCC+6.02
ASCL1MA1100.2chr3:5126374-5126384GGCAGCTGCC-6.02
ArMA0007.3chr3:5125756-5125773AGGAACACTCTGTGCTT-6.07
BHLHE40MA0464.2chr3:5125997-5126007GTCACGTGAT-6.02
EGR1MA0162.3chr3:5126751-5126765GATGCGGGGGCGTC-6.05
EGR3MA0732.1chr3:5126751-5126766GATGCGGGGGCGTCA-6.13
FOXK2MA1103.1chr3:5126355-5126366ATGTAAACACG+6.02
Nfe2l2MA0150.2chr3:5125592-5125607TGCTGAATCACTGTG-6.21
RREB1MA0073.1chr3:5125910-5125930CCCCAACACACACACGCACA+6.15
SOX15MA1152.1chr3:5126895-5126905CTATTGTTTT+6.02
SREBF2(var.2)MA0828.1chr3:5125997-5126007GTCACGTGAT-6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr3:5125997-5126007GTCACGTGAT-6.02
TFEBMA0692.1chr3:5125997-5126007GTCACGTGAT-6.02
Enhancer Sequence
GAATGAATGT GTATGGATGC TTCCCAGTGA TGGGTTGAGC TGGAAGGGCA TCTGCATTTT 60
AAAAATGTGC TGGAGAAGTT GGTGGTTCAT TCTGCTGTAG CGACCCCTGA TTAATAAAGG 120
GAATAAGCCG AAAAGAAAAT GAATATTTTC CTTCTAAAGA CGCATTTCCA TACTCATAAA 180
ATAAAGTCAA ATACAACAGC ATATTCCTTT ACAGTAATCA GAAAACCAAA GTCATCTAAT 240
AATCCACTGT AAGATAATAA ATGACCATTT AAATTTAGAA GTTGTCTAAC AATATCGTTT 300
TCATGCCACT TTTGGAAGAA AAGAAATTTG TTTTTATATT AAATATATCT ATTAATCCAA 360
ATAATATACA TGTTTGGGAA GAATTTGTGC TTAAATACCA TCATCCACGC CAATAAAGCT 420
TGTTTGTGAA GTTTAGCTAA TTTCACTTCA ATATATGCTC TGGGTGTGTT GAATTAATGC 480
GCAAGATCTA ATCAGAAAGT AGATCCGGCA AGAAAAAAAC GCGTCACGGT GGAGGGCGGA 540
GCACGCGCGC GTCGCGATAT AAATGCGCGA GCCTGTCAAA CACAGAAGTT TCCACGGGCG 600
CGTGCGGGAG CGGGGGACGC CGCCAATTAA ACACTGAATT ATAAACTAAT AAACACAAAT 660
AAAATCGCGA GTGAAGTGCG TTTCAGTCAA ACGCAACACA CCGCAGCGGC TCTCCGTGAA 720
GGACTTCCCA AACGCCACAA GCACGCAAAA CTGCTGATAC TCACCTGGAA ACCGTAAAAA 780
CAGGATAAAA ACACAACATT AGCATCTGTG AGTATTTATT TTACATTATT TATATGCATA 840
TTACATTAAC CACATTCATT TGATGAACGC GTCCTGCATG AACACATTAA TAATTGTTGT 900
TTATATATTT AAACTGGTCA GCTGTCGTCC ATTTTAGAGT GTTTGAAGAG AAAACAAATA 960
TAAAATAATA CAATAATGTG AAGCTGTTTA ATAATATATG GAGCATTAGC ATGCTGAATC 1020
ACTGTGTTGG CGTTTTAATT CGGGGTAAAT GTGTTCGCAC AGATGCCCTT GGCTCGCAAA 1080
CAGGCCAAAT GTTTGCAAAA GCTGATTATT ATATCTGCTG TCGGTGTGTA AACCGAGCTG 1140
CTGCACAGTT ATAAGCTCAT GTCTGGAGTT ACTCGAGGAA CACTCTGTGC TTTAGACATT 1200
TTGTGAATCG TCCAGAAAAA GTGCAACATA TCTGCAATTT ATCATGCATA TTGGTGTTAT 1260
TGATCCTCTT GTTTTAATTG TTGCTTGAGA TATTAGATTG CATGTTGAAA AACCTTTTTA 1320
CAAGGGAGTC CCCAACACAC ACACGCACAC ACACACATAC TTGCTGATCA GTTGTGTTTG 1380
TGTTGTCATG TAACACTCAT CACTGATAGT GTTTGGGTCA CGTGATGATG TTTCCAGGAG 1440
CACCGTTACT AATAATTGAA GCTGATCGAG ATAAAGGCGG GCGATTCATT ATATTCTGAG 1500
TGATTATAAG CTGATTATGA AGCTGATTTA GTTTACATGT TGTGAATCTA CTAAATATGT 1560
GGTGAGTGTG TGTGATTTTG CTCTTTAAGG AGTGTGAACA ATCAGGCAGT CTGCTGAATG 1620
AGTTGGTTTG CTGCAATTAA TTAACATGTT TGTCCCCTGT CAGGCGCGTT CTCGCGGTTG 1680
TTTTGATAAA CTTTGACATT GAGTGACATT GAATGCACGA TATCAGTGTT TGAAGTCGAC 1740
ACGAGATTGG TTTAGTGAAT CATATCAAAT GTAAATGTAA ACACGTTAAA TGTGGCAGCT 1800
GCCCATATCA AGGGGATATT AGAGGTGTAA TAGTTATTAT AGACAACATC GCTATTCACG 1860
GGTTAAGTAT AAATGTTTAA ACTAGAATAA AATTGTCTAA TTTTTGCTTT GAAATCGTGT 1920
TTTAAATTCG TTAATGACTG ATTAATTTAT TAAAAGTGCT GTTGTTATTA TTATTATTAT 1980
TTCTGAGCCA GTTTATGAGC GCGTTACTGA ATAAAACAAC CGTTTTAATA ACATTTACCG 2040
ACAGTGTGAC CGTTGTCATC TGTGCTGAAA CTCCTCGAGG ATCTGTTTTA AGCAGAAACA 2100
TGTCGAGTGC GGTGTTTGTA ATCAATATAA TTGTTAAAAG TGCTTTAACC GAGCTTATCA 2160
GTGTTTTGAA GATGCGGGGG CGTCACATCA ACATTCACAC GCGTGCTGAT GACGTCAAAC 2220
ACCCTGGCGT GCTGCATGCT GGGAGTTGCA GTTTTTCAAC GCGCTTATAC AGCACCATTT 2280
TATCAGCTCT TTAGTAAGGA TGAACGCCTG GTTACTATTG TTTTGTGGCA GCAGATGTCA 2340
TTTTGCAGAC ATGCTGAGAA GAGGT 2365