EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24016 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:4748843-4749732 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BACH2MA1469.1chr3:4749572-4749591ATTTCATGAGTCATCGAAA+6.36
GSX1MA0892.1chr3:4748935-4748945TTTAATTAGG-6.02
NFYAMA0060.3chr3:4749136-4749147GACCAATCAGA+6.14
NFYBMA0502.1chr3:4749131-4749146ACACGGACCAATCAG+7.39
NR2C2MA0504.1chr3:4749468-4749483AGAGGTCAGAGTTCG+6.35
POU4F1MA0790.1chr3:4749566-4749580ATGAATATTTCATG+6.06
POU4F2MA0683.1chr3:4749566-4749582ATGAATATTTCATGAG+6.36
POU4F3MA0791.1chr3:4749566-4749582ATGAATATTTCATGAG+6.61
Enhancer Sequence
CTTATTTTAA TAAAAATGAC AAACACTTAA CTGAAAACAC TAATTCAAAA TCAAAATGAT 60
GATAATAATA GTGACAATAA TGCCAGTAAC AGTTTAATTA GGCTGTAAGA CTGATAGTAA 120
ATGCAGGGAT TGCTCAAGCT GCTGATATGC CTGTCGCTGT GGTGTAACGC GTGATTCAGC 180
AGATCTGCAG TTTTCTGTGT CGATGATCTT TTAGCTGAGT GTGTTTGCTT GGCCACGCCT 240
CTTTAAACAA ACGCTATGGA AACCGAATGT TAAACAGAGG AGCGCTTCAC ACGGACCAAT 300
CAGAACGCAG GAAAACAAGA GACTCGGCTA AAGCCCGCCC CTTACCAAAA AGATTCGCCT 360
CAGTAAATCA CTCGGAGTAA ACAACAACAC ACTGTCGGAA ATGATCTCCG AAAACAGCCA 420
GAGACAGATT TTAAACGTTA ATTTAGCTCG AATAAGTGAT CATAAATAAT AATAAAATGT 480
TAAATATGTC GAGCTGAGAC GTCATTAACC GCCTCTGACA GCGCACAGTG CGAGTATGTA 540
CAGTCAGTCC AGCTATCAGT AAGCAGATAA CACCGCTGAT ACCAACCTAC AGCCTTAAGG 600
GCGACTGATG TGACCGGATC AACACAGAGG TCAGAGTTCG TGGAACTGCA GATATTTGAC 660
TGAATGTCCA CATCATTAAC ACACTCATTA CTGACACTGA CAGCCCAGAC AGTGAGATAA 720
AACATGAATA TTTCATGAGT CATCGAAAAA TGTATTGAAT ACCTCATATG AAAAATACTA 780
CAGTAAATTA TAGTAAATAG TGCTGTTTTT TAACCATACT ATGGTAAATT TATTATTAAG 840
CAAGTTCTAG TAATTCTATA GATGCTATAT GATAACACAG CAGAATAAT 889