EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-24012 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:4648064-4649072 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE40MA0464.2chr3:4648712-4648722GTCACGTGAT-6.02
IRF9MA0653.1chr3:4648504-4648519AGCAAAACCGAAACT+6.64
MITFMA0620.2chr3:4648708-4648726CGAAGTCACGTGATCTAT+6.6
MITFMA0620.2chr3:4648708-4648726CGAAGTCACGTGATCTAT-6.6
Pou2f3MA0627.1chr3:4648872-4648888CTGTATGCAAATGTAA+6.69
SREBF2(var.2)MA0828.1chr3:4648712-4648722GTCACGTGAT-6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr3:4648712-4648722GTCACGTGAT-6.02
TFEBMA0692.1chr3:4648712-4648722GTCACGTGAT-6.02
Enhancer Sequence
TAAAATTATT ATTGTACTAA TATTAATCTA CTGTCATCCT TAAAAGCATA TTTTACACTC 60
GTAATGCTGT TGTAAGTTTT ACACACATGC ATGTGAAGTC TACAGGTCTA CAGGTTTGTT 120
TTGTAATATC GTTTAATAAA ATCGCATGCA TCAGCCTACA ATGTTATCGT GGTGTGTTGG 180
GATAATGTGT GTTTGTAATG ATCTGAGTGT CGGTCTGGCT ATTCTTTGGT TCTTGACAAC 240
TATTTAAGTC ATGTGATGTA TTGTTGTGAT GACGTTGTTG ATACCGAGGA AAAGCACGCT 300
TAATGGCATT TCTTGGTGTT TGCCTCGTAA ATATATAAAT AAAAGTTATT AAAAAGTAAA 360
ACCAACAAAT GAAACATCAG TAGAGACAGT CATGTAGGAA ATAAAACACG GTTTCTTCTT 420
ACTTTCACTT TGCTGTAGCC AGCAAAACCG AAACTCAAGA CATTAGCATA AAGCTAACAT 480
TAGCTACTGG ACTCTCTAAA CGTATGAAAT GTCGCTTAAA CTTGAATGAA CCCTCAAAAA 540
GATACACATC CTGTCAGAAA AGCACAACTG CAAACTCGTA TGTTATTATT TTGACCCTAA 600
ACTCACCTGT GTCTGGAGAA ACACGGACTG CGCACTGCTT CCTGCGAAGT CACGTGATCT 660
ATCAGCCTGT GATATAATAA CGGGATGACG ATATTACTTA ATCAGCTCAT TTCCCACAGC 720
AAGTACATGT CTTATTTCCT TCTGTTAGCT TTTACTAATT TGAGCATAAT GATAAACACA 780
ACCAACAAAT GCTAACAAAA AGATGGTGCT GTATGCAAAT GTAAAACTTT GTTTTTCAGC 840
AGAGCTCCAC ATAGACGATC AAGTGTATCA AGACATTCAT AGAGGCTGGA TGATGAAACA 900
ACAATGAGAA TGGCTGGAAT AGAAGAAAAC ATGTTTGTTG AGCTTTGTAG TTTGATATAA 960
TGATCATTCT GTACATTTTA AGTGCACAAT CACACATTAG ACAAGGGC 1008