EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-23954 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:1626183-1627523 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXF2MA0030.1chr3:1626598-1626612TAAACATAAACAAA+6.3
Foxj3MA0851.1chr3:1626598-1626615TAAACATAAACAAAAGC+6.01
LMX1BMA0703.2chr3:1626872-1626883TTAATTAAATT-6.32
PHOX2AMA0713.1chr3:1626873-1626884TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr3:1626873-1626884TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr3:1626873-1626884TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr3:1626873-1626884TAATTAAATTA-6.62
SOX15MA1152.1chr3:1626418-1626428CTATTGTTTT+6.02
TCF3MA0522.2chr3:1627339-1627349AGCAGGTGTT-6.02
ZNF143MA0088.2chr3:1626704-1626720CTCCCAGCATGCATTG+6.21
Enhancer Sequence
CGTCACCATC ATGGAGAACA GAGTTTGCTT TAGTTGGGCT CTTAGCCCTG TCATTTTTAA 60
CATTTATATA TCTTGGCTGC TGCAATTGTT AAGAACTTTG TTTAAAAAGC TCTTTTGTTG 120
AGGCAAGCCA GCCAAAAACC TAAATAAGAT CTGGTGATGT TCATGTTGCT ATTAAATGGC 180
AGAGTCTGTT CTCATTTAGT ATAACAAAAT TTACTGCTCC TATTCAATGT TAAATCTATT 240
GTTTTACTTT ATATGGCAAT GATTTCTGGA AGTTTTTAAG AATATCTTGG ACAATAACAC 300
TGCTCTATGG TGTATATCGC ACTCAAAGAG ACATCTATAA ACAGCATATG AACCTCAATA 360
ATGGTGACAA CTAACAAAAT TAACAGTTTA ACTCACAAAC AGGCAACTGA AAGTCTAAAC 420
ATAAACAAAA GCAGAATCAA ACACAAATAA AGAAAACTGT GAGACCATTA TACAACATTT 480
ATTTATACCG CAATGCATGC TGGGATATTT GTACCGTGCC ACTCCCAGCA TGCATTGCAG 540
CATGAAACAT TTGAGATGTT ACCATTATTG AGATACAAGG TCAGATTCAT GAGGTCTGAG 600
TGTGTATTTG TCATAACTGA ACTGTTTTTG TATGTTATTT CTTAACTGTT AAGTAATTAT 660
GGAGGTATCT TTTCTGTTTC CACTTCTCAT TAATTAAATT AATACCTGCA ACTAAGCATA 720
AAATCTATTG CATGAGGCCC TTCTTCCAGA TTTATAACAA AACATTTATC AGAACTAATT 780
TCAGACAAAT AGATTTCTCT ATTTATTGAC TTCCCAACTT TATTGCTATA GTTTAAACGT 840
TTTGTAAACT CTGTATTACA GCAGTTGGAA AGTCTTATTA AATGAGTTCA AGGGTGAAGA 900
GCCCAACTAA ATCAGCCCCT CACTCCATTA TGGTGACACA AAAAACACCT TAATTTCTGT 960
TGGATCTCAA TGAGAATAGT ATGGAAGTCA AATCAGTCAG TAATAAGTGT GTGTCTGCTG 1020
TTGTTTGTGG AGTTGTTTAA TGATCCTCTG CTGAGACTGA AGCTGTTTTA TTTTATTTTA 1080
TTTTATTTAA TGTTGTAACT CAAGTCACTG TTTGTGTTTC TTGTTTCTCT TTCCTTCAGT 1140
AATTGTGATT ATTAACAGCA GGTGTTCATC AGTGTCTGAA TTCACTCATT AGTGTTCATT 1200
AACTCTGTCA GGTGAACTAT ATTGGTGAAC TAGTTGATGG AATAGTGAAC AAGAGCACAA 1260
AGTGTGATTT TAAACACAGA CTTCAAAACA TCGAATCTGA ACTCTGTTAG CTCACAGTTT 1320
TCTGCAGTTG GTTACTTTCT 1340